# Predicted new candidate miRNA sequences in four-way alignment (human/mouse/rat/dog) # header line: id chr start end strand score # predicted mature sequences are highlighted in UPPER case # predicted structures are based in RNAfold program, with folding energy following each computationally predicted structures # >PREDICTED_MIR12 chr20 33041853 33041955 + tgccttgggcgggcggctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTaactcctctccacgtgaacatcacagcaagtctgtgctgcttcccgtccctacgctgcctggg tgtcttgggtgggcagctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTagctcctctgcatgtgaacatcacagcaagtctgtgctgctgcctgcccccatgctgcctggg tgtcttgggtgggcagctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTagctcctctccatgtgaacatcacagcaagtctgtgctgctgcctgcccccatgctgcctggg caccctgggcgggcggccGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTaactcctctccacgtgaacatcacagcaagtctgtgctgcttcccgtccccacgctgcctggg * **** **** ** *********************** ******* ** **************************** ** * *** * ********** ((....(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))...)))........ -45.42 (((...(((..((((((.((..((((((((.((((((((((((......))...)))))))))).))))))))..)).))))))..)))..))))........ -52.20 ......(((..((((((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))))))..)))....)).))))).. -55.56 ((....(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))......)))..... -45.12 # 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