# All predicted candidate miRNA sequences in four-way alignment (human/mouse/rat/dog) # header line: id chr start end strand score match_to_known_miRNA_if_found # predicted mature sequences are highlighted in UPPER case # predicted structures are based in RNAfold program, with folding energy following each computationally predicted structures # >PREDICTED_MIR1 chr17 6861657 6861767 - 19.191 hsa-mir-195 tggagtctttgttgcccacacccagcttccctggctcTAGCAGCACAGAAATATTGGCAcagggaagcgagtctgccaatattggctgtgctgctccaggcagggtggtga tagagtctttgttgcccacacccaactctcctggctcTAGCAGCACAGAAATATTGGCAtggggaagtgagtctgccaatattggctgtgctgctccaggcagggtggtga tagagtctttgttgcccacacccaactctcctggctcTAGCAGCACAGAAATATTGGCAcgggtaagtgagtctgccaatattggctgtgctgctccaggcagggtggtga tagagtctttgttgcccacacccagctcccctggctcTAGCAGCACAGAAATATTGGCActgggaagagagtctgccaatattggctgtgctgctctaggcagggtggtga * ********************** ** ****************************** ** *** **************************** ************** ..................((((......(((((.((..((((((((((.((((((((((..............))))))))))..))))))))))..)).))))).)))). -47.64 ..................((((..((((((((((....((((((((((.((((((((((.((.........))))))))))))..))))))))))))))).))))))))). -49.40 ..................((((..((((((((((....((((((((((.((((((((((.((.(.....).))))))))))))..))))))))))))))).))))))))). -50.90 ........................((..(((((.((..((((((((((.((((((((((((........)))..)))))))))..))))))))))..)).)))))..)).. -48.00 # aligned and folded structure * ********************** ** ********************.********** ** *** * tggagtctttgttgcccacacccagcttccctggctcTAGCAGCACAGA.AATATTGGCAcagggaagcg tagagtctttgttgcccacacccaactctcctggctcTAGCAGCACAGA.AATATTGGCAtggggaagtg tagagtctttgttgcccacacccaactctcctggctcTAGCAGCACAGA.AATATTGGCAcgggtaagtg tagagtctttgttgcccacacccagctcccctggctcTAGCAGCACAGA.AATATTGGCActgggaagag | |||| | ||||| || |||||||||| |||||||||| || | 4 4444 4 44444 44 4444444444 4444444444 24 1 | |||| | ||||| || |||||||||| |||||||||| || | a.................gtgg..t...gggacggatctcgtcgtgtcggttataaccgt.ctga..... a.................gtgg..t...gggacggacctcgtcgtgtcggttataaccgt.ctga..... a.................gtgg..t...gggacggacctcgtcgtgtcggttataaccgt.ctga..... a.................gtgg..t...gggacggacctcgtcgtgtcggttataaccgt.ctga..... *.................****..*...******** ***********************.****..... >PREDICTED_MIR2 chr17 53763580 53763690 - 18.812 hsa-mir-142 gacggacagacagacagtgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactggagggTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGatgagtgtactgtgggcttcggagat gacagacagacag----tgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactggagggTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGatgagtgcactgtgggcttcggagac gacagacagacagacagtgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactggagggTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGatgagtgtactgtgggcttcggagat gacggacagacagacagtgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactggagggTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGatgagtgtactgtgggcttcggagac *** ********* *************************************************************************** ***************** ..(.((.((.(..((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((...(..(....)..)..))))))))).))))))))))).))).))))))))..))))).).... -47.90 ((.((.(..((((----((((.(((.(((((((((((.(((((((((...(..(....)..)..))))))))).))))))))))).))).))))))))..)))))...... -48.60 ....((.((.(..((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((...(..(....)..)..))))))))).))))))))))).))).))))))))..)))))...... -46.80 ..(.((.((.(..((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((...(..(....)..)..))))))))).))))))))))).))).))))))))..))))).).... -47.90 # aligned and folded structure **..* ********* ***************************************** ga..cggacagacagacagtgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactg ga..cagacagacag----tgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactg ga..cagacagacagacagtgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactg ga..cggacagacagacagtgcagtcacccataaagtagaaagcactactaacagcactg | | || || | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | | 4 4 44 44 4 33334444 444 44444444444 444444444 4 4 | | || || | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | | cagaggct.tc.gggtgtcatgtgagtaGGTATTTCATCCTTTGTGATGTg.ggag.... tagaggct.tc.gggtgtcatgtgagtaGGTATTTCATCCTTTGTGATGTg.ggag.... cagaggct.tc.gggtgtcacgtgagtaGGTATTTCATCCTTTGTGATGTg.ggag.... tagaggct.tc.gggtgtcatgtgagtaGGTATTTCATCCTTTGTGATGTg.ggag.... *******.**.******** ******************************.****.... >PREDICTED_MIR3 chr1 202149083 202149187 - 18.800 hsa-mir-135b cc-tccactctgctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGAttgctgtcccaaactcatgtagggctaaaagccatgggctacagtgaggggcgagctccttct cc-tccgctctgctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGAttgctgctccgaactcatgtagggctaaaagccatgggctacagtgaggggcaagctcct--- cc-tccgctctgctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGAttgctgttccgaactcatgtagggctaaaagccatgggctacagtgaggggcaagctcct--- ccctcagctctgctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGAttgctgtttctaattcatgtagggctaaaagccatgggctacagtgaggggcgtgctccttct ** ** ****************************************** * ** ************************************** ****** .(-((..(((((((((((((((((((((((...(((((((((((((......)))..))))))))))..))))))))))))))))))).))))..)))........ -49.90 ..-.((.(((.(((((((((((((((((((...(((((((((((((......)))..))))))))))..)))))))))))))))))))))).)).........--- -49.80 ..-.((.(((.(((((((((((((((((((...(((((((((((((......)))..))))))))))..)))))))))))))))))))))).)).........--- -49.80 (((((......(((((((((((((((((((...((((((((((..............))))))))))..))))))))))))))))))))))))............. -49.74 # aligned and folded structure *.......* ** ****.********************************..****** c.......c-tccactct.gctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGA..ttgctgtcc c.......c-tccgctct.gctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGA..ttgctgctc c.......c-tccgctct.gctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGA..ttgctgttc c.......cctcagctct.gctgtggcctATGGCTTTTCATTCCTATGTGA..ttgctgttt | || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| 4 32 4444 4444444444444444444 4444444444 434 | || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| tcttcctcg.tgcggggagtgacatcgggtaccgaaaatc.gggatgtacttaatc...... ---tcctcg.aacggggagtgacatcgggtaccgaaaatc.gggatgtactcaagc...... ---tcctcg.aacggggagtgacatcgggtaccgaaaatc.gggatgtactcaagc...... tcttcctcg.agcggggagtgacatcgggtaccgaaaatc.gggatgtactcaaac...... ******. ****************************.********** ** *...... >PREDICTED_MIR4 chr11 72003731 72003835 - 18.726 hsa-mir-139 gggactgg-ctcaggtgtattCTACAGTGCACGTGTCTCCAGTgtggctcggaggctggagacgcggccctgttggagtaacaactgaagccggagtctgcgaagg aggacagg-cgcaggtgtattCTACAGTGCACGTGTCTCCAGTgtggctcggaggctggagacgcggccctgttggagtaacaactgaagccagagtcttcgaagg aggacagg-cgcaggtgtattCTACAGTGCACGTGTCTCCAGTgtggctcggaggctggagacgcggccctgttggagtaacaactgaagccagagtcttcgaagg aggactgggctcaggtgtattCTACAGTGCACGTGTCTCCAGTgtggctccgaggctggagacgcggccctgttggaataacaactgaagccggagtctgcggagg **** ** * *************************************** ************************** ************** ****** ** *** .(((((((-(((((.((((((((((((.((.((((((((((((...........)))))))))))))).))).)))))).))).))).))))..)))))....... -50.00 (((((.((-(.(((.((((((((((((.((.((((((((((((...........)))))))))))))).))).)))))).))).)))..)))...)))))...... -45.70 (((((.((-(.(((.((((((((((((.((.((((((((((((...........)))))))))))))).))).)))))).))).)))..)))...)))))...... -45.70 .(((((.(((((((.((((((((((((.((.((((((((((((.((....))..)))))))))))))).))).)))))).))).))).))))..)))))....... -52.90 # aligned and folded structure ...... **** ..** * .*******.******.********************.****** ......gggact..gg-ct.caggtgt.attCTA.CAGTGCACGTGTCTCCAGTg.tggctc ......aggaca..gg-cg.caggtgt.attCTA.CAGTGCACGTGTCTCCAGTg.tggctc ......aggaca..gg-cg.caggtgt.attCTA.CAGTGCACGTGTCTCCAGTg.tggctc ......aggact..gggct.caggtgt.attCTA.CAGTGCACGTGTCTCCAGTg.tggctc |||||| || || ||| ||| |||||| ||| || |||||||||||| || 244442 44 42 444 444 444444 444 44 444444444444 41 |||||| || || ||| ||| |||||| ||| || |||||||||||| || ggaggcgtctgaggcc.gaagtcaacaataaggttgtcccg.gcgcagaggtcggagc.... ggaagcttctgagacc.gaagtcaacaatgaggttgtcccg.gcgcagaggtcggagg.... ggaagcttctgagacc.gaagtcaacaatgaggttgtcccg.gcgcagaggtcggagg.... ggaagcgtctgaggcc.gaagtcaacaatgaggttgtcccg.gcgcagaggtcggagg.... *** ** ****** **.************ ***********.*************** .... >PREDICTED_MIR5 chr2 219092865 219092969 + 18.644 hsa-mir-26b cc--acc----ctgcccgggacccagTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgt-gtgctgtccagcctgttctccattacttggctcggggaccggtgccctgcagccttggggt tcttacccctactgcccgggacccagTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgtggtgctgaccagcctgttctccattacttggctcgggggccggtgccctgcagccttggggt tcttacccccactgcccgggacccagTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgtggtgctggccagcctgttctccattacttggctcgggggccggtgccctgcagccttggggt cc--acg----ttgcccgggacccagTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgt-gtgctgtccagcctgttctccattacttggctcgggggccggcgccctgcagccttggggc * ** ************************************** ****** ****************************** **** ***************** ..--(((----((((((((..((((((.((((((((..(((((((((((.-........)))))))))))..))))))))))).)))..)))).))...........))))) -47.20 ....(((((..((((((((..((((((.((((((((..(((((((((..((((....)))))))))))))..))))))))))).)))..))))......))))....))))) -51.70 ......(((((((((((((..((((((.((((((((..(((((((((..((((....)))))))))))))..))))))))))).)))..))))......))))...))))). -51.30 ((--(.(----((((((((..((((((.((((((((..(((((((((((.-........)))))))))))..))))))))))).)))..))))......)))))..)))... -45.30 # aligned and folded structure * ** *...........**.*********.************************** ****** cc--acc----ct...........gc.ccgggaccc.agTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgt-gtgctg tcttacccctact...........gc.ccgggaccc.agTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgtggtgctg tcttacccccact...........gc.ccgggaccc.agTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgtggtgctg cc--acg----tt...........gc.ccgggaccc.agTTCAAGTAATTCAGGATAGGTTgt-gtgctg ||| || || |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || 343 44 44 4444 444 444 44444444 44444444444 42 ||| || || |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || ....cgg....ggttccgacgtcccgcggccgggggctcg.gttcattacctcttgtccgac..ct.... ....tgg....ggttccgacgtcccgtggccgggggctcg.gttcattacctcttgtccgac..cg.... ....tgg....ggttccgacgtcccgtggccgggggctcg.gttcattacctcttgtccgac..ca.... ....tgg....ggttccgacgtcccgtggccaggggctcg.gttcattacctcttgtccgac..ct.... .... **....*************** **** ********.*********************..* .... >PREDICTED_MIR6 chr7 99336026 99336130 - 18.136 hsa-mir-93 acctc-agtcctgggggctccAAAGTGCTGTTCGTGCAGGTAGtgtgattacccaacctactgctgagctagcacttcccgagcccccgggacacgttctctctgc acctt-agtcatgggggctccAAAGTGCTGTTCGTGCAGGTAGtgtaattacctgacctactgctgagctagcacttcccgagcccccaggacacaacctct---- acctttagtcatgggggctccAAAGTGCTGTTCGTGCAGGTAGtgc-attgcctgacctactgctgagctagcacttcccgagcccccaggacacagcctct---- acctt-agtcccgggggctccAAAGTGCTGTTCGTGCAGGTAGtgtgattacctgacctactgctgagctagcacttcccgagccccagggatgcgacctctctgc **** **** ********************************* *** ** ******************************** *** * **** .....-.(((((((((((((..((((((((((((.((((.(((..((......))..)))))))))))).)))))))...)))))))))))))............. -54.60 .....-.(((.(((((((((..((((((((((((.((((.(((.((.........)))))))))))))).)))))))...))))))))).))).........---- -47.20 .......(((.(((((((((..((((((((((((.((((.(((..(-(.....))..)))))))))))).)))))))...))))))))).))).........---- -48.20 .....-.(((((.(((((((..((((((((((((.((((.(((.((.........)))))))))))))).)))))))...))))))).)))))............. -47.00 # aligned and folded structure **** *......*** **********.*******.****************. *** ** acctc-a......gtcctgggggctccA.AAGTGCT.GTTCGTGCAGGTAGtg.tgattacc acctt-a......gtcatgggggctccA.AAGTGCT.GTTCGTGCAGGTAGtg.taattacc accttta......gtcatgggggctccA.AAGTGCT.GTTCGTGCAGGTAGtg.c-attgcc acctt-a......gtcccgggggctccA.AAGTGCT.GTTCGTGCAGGTAGtg.tgattacc | | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| | || 2 4 4442434444444 4444444 44444 4444 444 4 43 | | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| | || cgtctctccagcgtagggaccccgagcccttcacgatcgagt.cgtc.atc.cagt...... ----tctccgacacaggacccccgagcccttcacgatcgagt.cgtc.atc.cagt...... ----tctccaacacaggacccccgagcccttcacgatcgagt.cgtc.atc.cagt...... cgtctctcttgcacagggcccccgagcccttcacgatcgagt.cgtc.atc.caac...... **** * *** ***********************.****.***.** ...... >PREDICTED_MIR7 chr9 94927278 94927382 + 17.969 hsa-mir-27b gatgacctctctaacaaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgattggtttccgcttTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGcacctgaagagaaggtgagat gatgacctctctaacaaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgattggtttccgcttTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGcacctgaagagaaggtgagat gatgacctctctaacaaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgattggtttccgcttTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGcacctgaagagaaggtgagat gacgacctctctgccgaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgactggtttccgcttTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGcacctgaagagaaggtgagat ** ********* * ********************************* ******************************************************* ....((((((((....((((((((((((((((((....((((((((....(((...)))..))))))))..))))))))))))))))))..)))).))))..... -50.80 ....((((((((....((((((((((((((((((....((((((((....(((...)))..))))))))..))))))))))))))))))..)))).))))..... -50.80 ....((((((((....((((((((((((((((((....((((((((....(((...)))..))))))))..))))))))))))))))))..)))).))))..... -50.80 ....((((((((....((((((((((((((((((....((((((((....(((...)))..))))))))..))))))))))))))))))..)))).))))..... -50.80 # aligned and folded structure ** *.****.**** * ********************************* ****** gatg.acct.ctctaacaaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgattggttt gatg.acct.ctctaacaaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgattggttt gatg.acct.ctctaacaaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgattggttt gacg.acct.ctctgccgaggtgcagagcttagctgattggtgaacagtgactggttt | | |||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||| 4 4 4444 4444 1 444444444444444444 4 44444444 4 444 | | |||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||| tagagtggaagagaag..tccacGTCTTGAATCGGTGA..CACTTGTttc..gcc... tagagtggaagagaag..tccacGTCTTGAATCGGTGA..CACTTGTttc..gcc... tagagtggaagagaag..tccacGTCTTGAATCGGTGA..CACTTGTttc..gcc... tagagtggaagagaag..tccacGTCTTGAATCGGTGA..CACTTGTttc..gcc... ****************..********************..**********..***... >PREDICTED_MIR8 chr1 9145997 9146101 - 17.959 hsa-mir-34a gccagctgtgagtgtttcttTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTtgtgagcaatag-taaggaagcaatcagcaagtatactgccctagaagtgctgcacgttgtggg gccagctgtgagtaattcttTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTtgtgagtattagctaaggaagcaatcagcaagtatactgccctagaagtgctgcacattgttgg gccggctgtgagtaattcttTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTtgtgagtattagctaaggaagcaatcagcaagtatactgccctagaagtgctgcacgttgttag gccagctgtgagtgtttcttTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTtgtgagtaatagtgaaggaagcaatcagcaagtatactgccctagaagtgctgcacgttgttgg *** ********* ********************************* * *** ****************************************** **** * ..((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)-).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))).... -45.20 .(((((((((((((.((((..(((((((((((.((((((((((...(((....))).....))))))))))))).))))))))..)))).)))).))))..))))) -47.50 ..((((.(((((((.((((..(((((((((((.((((((((((...(((....))).....))))))))))))).))))))))..)))).)))).))))))).... -43.90 .(((((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))))) -46.37 # aligned and folded structure **...* ******.*** **************.******************.*. * ** gc...cagctgtg.agtgtttcttTGGCAGTGT.CTTAGCTGGTTGTtgtga.g.caata gc...cagctgtg.agtaattcttTGGCAGTGT.CTTAGCTGGTTGTtgtga.g.tatta gc...cggctgtg.agtaattcttTGGCAGTGT.CTTAGCTGGTTGTtgtga.g.tatta gc...cagctgtg.agtgtttcttTGGCAGTGT.CTTAGCTGGTTGTtgtga.g.taata | |||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | | | 4 4443 444 444424444 44444444 444 4444444444 4 3 4 | |||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | | | .ggttgttg.cacgtcgtgaagatcccgtcatatgaa.cgactaacgaaggaagtg.... .gattgttg.cacgtcgtgaagatcccgtcatatgaa.cgactaacgaaggaatcg.... .ggttgtta.cacgtcgtgaagatcccgtcatatgaa.cgactaacgaaggaatcg.... .gggtgttg.cacgtcgtgaagatcccgtcatatgaa.cgactaacgaaggaat-g.... .* **** .***************************.*************** *.... >PREDICTED_MIR9 chr1 65236125 65236235 - 17.941 hsa-mir-101-1 gaccgacacagtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtctattctaaaggTACAGTACTGTGATAACTGAAGgatggcagccatcttacctt gacggacacggtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtccattctaaaggTACAGTACTGTGATAACTGAAGgatggcagccatcttgcctt gacagacgtggtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtccattctaaaggTACAGTACTGTGATAACTGAAGgatggcagccatcttgcctt ggcacacactgtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtccattctaaaggTACAGTACTGTGATAACTGAAGgatggcagccatcttgcctt * * ** ************************************************ *********************************************** **** ....................(((((((.....((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))).....))))))).......... -47.30 ...((.((............(((((((.....((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))).....)))))))....)))).. -45.19 .........((..(..((..(((((((.....((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))).....))))))).)))..)).. -50.00 ((((................(((((((.....((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))).....)))))))....)))).. -48.45 # aligned and folded structure * * ** ************************************************ ******** gaccgacacagtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtctattctaaa gacggacacggtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtccattctaaa gacagacgtggtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtccattctaaa ggcacacactgtgactgacaggctgccctggctcagttatcacagtgctgatgctgtccattctaaa || || || | || ||||||| | |||||||||||||||||| |||| 44 13 34 4 44 4444444 4 444444444444444444 4444 || || || | || ||||||| | |||||||||||||||||| |||| tt.cc.gt.....t..cta.ccgacggtagGAAGTCAATAGTGTCATGAC.ATgg............ tt.cc.gt.....t..cta.ccgacggtagGAAGTCAATAGTGTCATGAC.ATgg............ tt.cc.gt.....t..cta.ccgacggtagGAAGTCAATAGTGTCATGAC.ATgg............ tt.cc.at.....t..cta.ccgacggtagGAAGTCAATAGTGTCATGAC.ATgg............ **.**. *.....*..***.******************************.****............ >PREDICTED_MIR10 chr18 17659646 17659750 + 17.675 hsa-mir-133a-1 tcccgtagtaatcaatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggcgATTTGGTTCCATTTTACCAGCTctagcaaagcattgtagtgct tccatgtgtaatcaatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggcgATTTGGTTCCATTTTACCAGCTttagcaaagcattgc--cgct tcctgtggcaatcaatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggcgATTTGGTTCCATTTTACCAGCTttagcaaagcattgc--cgct tcctgtagtaatcaatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggcgATTTGGTTCCATTTTACCAGCTctagcaaagcattgcagtgct *** * *************************************************************************** ************* *** ......((((..((((((...((((.(((((((.(((.(((((((((((............))))))))))).))).))))))).))))...))))))...)))) -44.60 .....(((....((((((...((((.(((((((.(((.(((((((((((............))))))))))).))).))))))).))))...)))))).--))). -42.30 ....((((((....((((...((((.(((((((.(((.(((((((((((............))))))))))).))).))))))).))))...)))))))--))). -46.80 ......((((..((((((...((((.(((((((.(((.(((((((((((............))))))))))).))).))))))).))))...))))))...)))) -43.90 # aligned and folded structure *** * ***.************************************************* tcccgtagtaat.caatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggc tccatgtgtaat.caatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggc tcctgtggcaat.caatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggc tcctgtagtaat.caatgcatagctacagctggttgaaggggaccaaatccattgaagaggc |||| | |||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| 3442 2 444444 4 4444 4444444 444 44444444444 |||| | |||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ......tcgtgacgttacgaaacgatcTCGACCATTTTACCTTGGTTTAg............ ......tcgc--cgttacgaaacgattTCGACCATTTTACCTTGGTTTAg............ ......tcgc--cgttacgaaacgattTCGACCATTTTACCTTGGTTTAg............ ......tcgtgatgttacgaaacgatcTCGACCATTTTACCTTGGTTTAg............ ......*** ************* ***********************............ >PREDICTED_MIR11 chr17 1899948 1900058 - 17.614 hsa-mir-132 cgcgccccgcccccgcgtctccagggcaaccgtggctttcgattgttactgtgggaactggaggTAACAGTCTACAGCCATGGTCGccccgcagcacgcccacgcgccgcg -aagccccgcccccgcgtctccagggcaaccgtggctttcgattgttactgtgggaaccggaggTAACAGTCTACAGCCATGGTCGccccgcagcacgcccacgctcccca -aagccccgcccccgcgtctccagggcaaccgtggctttcgattgttactgtgggaaccggaggTAACAGTCTACAGCCATGGTCGccccgcagcacgcccacgctcccca cgcgccccgcccccgcgtctccagggcaaccgtggctttcgattgttactgtgggaaccggaggTAACAGTCTACAGCCATGGTCGccccgcagcacgcccacgcgccgcg ******************************************************* ********************************************** ** * ((((...(((....((((((.(.((((.(((((((((...((((((((((..(....)....))))))))))...))))))))).)))).).)).))))....))).)))) -53.20 -.......((....((((((.(.((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).)))).).)).))))....))...... -47.10 -.......((....((((((.(.((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).)))).).)).))))....))...... -47.10 ((((...(((....((((((.(.((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).)))).).)).))))....))).)))) -53.50 # aligned and folded structure ***************.*********************************.*.***** cgcgccccgcccccgcgt.ctccagggcaaccgtggctttcgattgttactg.t.gggaa -aagccccgcccccgcgt.ctccagggcaaccgtggctttcgattgttactg.t.gggaa -aagccccgcccccgcgt.ctccagggcaaccgtggctttcgattgttactg.t.gggaa cgcgccccgcccccgcgt.ctccagggcaaccgtggctttcgattgttactg.t.gggaa |||| ||| |||| || | |||| ||||||||| | |||||||||| | | 2224 244 4444 44 4 4444 444444444 4 4444444444 4 4 |||| ||| |||| || | |||| ||||||||| | |||||||||| | | gcgcc..gcgcacccgcacgacgccccGCTGGTACCGACATCTGACAATggaggcc.... acccc..tcgcacccgcacgacgccccGCTGGTACCGACATCTGACAATggaggcc.... acccc..tcgcacccgcacgacgccccGCTGGTACCGACATCTGACAATggaggcc.... gcgcc..gcgcacccgcacgacgccccGCTGGTACCGACATCTGACAATggaggtc.... * **.. ********************************************** *.... >PREDICTED_MIR12 chr20 33041853 33041955 + tgccttgggcgggcggctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTaactcctctccacgtgaacatcacagcaagtctgtgctgcttcccgtccctacgctgcctggg tgtcttgggtgggcagctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTagctcctctgcatgtgaacatcacagcaagtctgtgctgctgcctgcccccatgctgcctggg tgtcttgggtgggcagctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTagctcctctccatgtgaacatcacagcaagtctgtgctgctgcctgcccccatgctgcctggg caccctgggcgggcggccGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTaactcctctccacgtgaacatcacagcaagtctgtgctgcttcccgtccccacgctgcctggg * **** **** ** *********************** ******* ** **************************** ** * *** * ********** ((....(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))...)))........ -45.42 (((...(((..((((((.((..((((((((.((((((((((((......))...)))))))))).))))))))..)).))))))..)))..))))........ -52.20 ......(((..((((((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))))))..)))....)).))))).. -55.56 ((....(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))......)))..... -45.12 # aligned and folded structure * **** **** ** ***********************... ******* tgccttgggcgggcggctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTa...actcctct tgtcttgggtgggcagctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTa...gctcctct tgtcttgggtgggcagctGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTa...gctcctct caccctgggcgggcggccGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTa...actcctct ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| || 432 44444442444 44 44444444 4444444444 21 ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| || gcacc.cctgcccttcgtcgtgtctgaacgacactacaagtgcacc...... gtacc.cccgtccgtcgtcgtgtctgaacgacactacaagtgtacc...... gtacc.cccgtccgtcgtcgtgtctgaacgacactacaagtgtacg...... gcatc.cctgcccttcgtcgtgtctgaacgacactacaagtgcacc...... * * *.** * ** **************************** ** ...... >PREDICTED_MIR13 chr12 6943102 6943206 + 16.988 hsa-mir-200c ggtgggcgggctgggcgggggccctcgtcttacccagcagtgtttgggtgc-ggttgggagtcTCTAATACTGCCGGGTAATGATggaggcccctgtccctgtgtc ggtggactggttgggtaggggccctcgtcttacccagcagtgtttgggtgctggttgggagtcTCTAATACTGCCGGGTAATGATggaggcccctgtcccagtgtc ggtggactggttgggtaggggccctcgtcttacccagcagtgtttgggtgctggttgggagtcTCTAATACTGCCGGGTAATGATggaggcccctgcccctgtgtc cgtgggcaggctgggtgggggcccccgtcttacccagcagtgtttgggtgctggttgggagtcTCTAATACTGCCGGGTAATGATggaggcccctgcccctgtgtc **** * ** **** ******* ************************** ******************************************** *** ***** .....(((((...((((((((((..((((((((((.((((((((.(((.((-........))))).)))))))).)))))).))))..)))))))))))))))... -58.80 ....(((...(((((((((((((..((((((((((.((((((((.(((.(((.......)))))).)))))))).)))))).))))..)))))))).))))).))) -57.90 ....(((.....(((((((((((..((((((((((.((((((((.(((.(((.......)))))).)))))))).)))))).))))..)))))))))))....))) -59.50 .....(((((...((..((((((.(((((((((((.((((((((.(((.(((.......)))))).)))))))).)))))).))))).))))))..)))))))... -61.50 # aligned and folded structure ****.. * ** **** ******* ****.********************** ******* ggtgg..gcgggctgggcgggggccctcgtc.ttacccagcagtgtttgggtgc-ggttggg ggtgg..actggttgggtaggggccctcgtc.ttacccagcagtgtttgggtgctggttggg ggtgg..actggttgggtaggggccctcgtc.ttacccagcagtgtttgggtgctggttggg cgtgg..gcaggctgggtgggggcccccgtc.ttacccagcagtgtttgggtgctggttggg | ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||| 4 44344 4444444444 44444 444444 44444444 444 443 | ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ....ctgtgtcc...ccgtccccggaggTAGTAATGGGCCGTCATAATCTc.tga....... ....ctgtgtcc...ccgtccccggaggTAGTAATGGGCCGTCATAATCTc.tga....... ....ctgtgacc...ctgtccccggaggTAGTAATGGGCCGTCATAATCTc.tga....... ....ctgtgtcc...ctgtccccggaggTAGTAATGGGCCGTCATAATCTc.tga....... ....***** **...* **********************************.***....... >PREDICTED_MIR14 chr19 13808243 13808353 - 16.797 hsa-mir-27a ggccccgaagcctg----tgcctggcctgaggagcagggcttagctgcttgtgagcagggtccaca-ccaagtcgtgTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCccccaggccctcacctc agcct---atcatga---caactggcctgaggagcagggcttagctgcttgtgagcaaggtccacagcaaagtcgtgTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCccctggaccc-catctc agccc---agcatga---ccactggcctgtggagcagggcttagctgcttgtgagcaaggtctacagcaaagtcgtgTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCccctggaccc-catctc ggccc---ctgctgtcttcgtctggcctggggagcagggcttagctgcttgtgagcagagtccaca-ccaagtcgtgTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCccccgggaccccgcctc *** ** ******** *************************** *** *** * ********************************* * ** * *** .............(----((...((((((.((.((.(((((((((..((.(((((((.((.(....-....))).)))))))))..))))))))).)).)).))))))..)))... -50.30 .....---.......---.....((((.(.((.((.(((((((((..((.(((((((.((............)).)))))))))..))))))))).)).))).)).)).-...... -37.20 ...((---((.....---...............((.(((((((((..((.(((((((.((.((.......)))).)))))))))..))))))))).))...))))....-...... -32.30 (((..---...............(((((((((.((.(((((((((..((.(((((((((.(.....-...).)).)))))))))..))))))))).)).))))))).))..))).. -50.71 # aligned and folded structure .. *** ** ******** *************************** *** *** * * ..ggccccgaagcctg----tgcctggcctgaggagcagggcttagctgcttgtgagcagggtccaca-cca ..agcct---atcatga---caactggcctgaggagcagggcttagctgcttgtgagcaaggtccacagcaa ..agccc---agcatga---ccactggcctgtggagcagggcttagctgcttgtgagcaaggtctacagcaa ..ggccc---ctgctgtcttcgtctggcctggggagcagggcttagctgcttgtgagcagagtccaca-cca | | || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || || 2 4 22 432444144 44 4444444444444 4444444 34 41 | | || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || || ctc............c....gccc.cagggccccCCGCCTTGAATCGGTGA.CACTTgtgct.ga....... ctc............t....ac-c.ccaggtcccCCGCCTTGAATCGGTGA.CACTTgtgct.ga....... ctc............t....ac-c.ccaggtcccCCGCCTTGAATCGGTGA.CACTTgtgct.ga....... ctc............c....actc.ccggaccccCCGCCTTGAATCGGTGA.CACTTgtgct.ga....... ***............ .... * *.* * ********************.**********.**....... >PREDICTED_MIR15 chr1 168845332 168845436 - 16.699 hsa-mir-199a-2 gcttctggagatcctgctccgtcgccccagtgttcagactacctgttcaggacaatgccgttGTACAGTAGTCTGCACATTGGTtagactgggcaagggagagca gcttcaggagatcctgctccgtcgccccagtgttcagactacctgttcaggacaatgccgttGTACAGTAGTCTGCACATTGGTtagactgggcaagggccagca gcttctggagatcctgctccgtcgccccagtgttcagactacctgttcaggacaatgccgttGTACAGTAGTCTGCACATTGGTtagactgggcaagggccagca gcttctggagatcctgctccgtcgccccagtgttcagactacctgttcaggacaatgccgttGTACAGTAGTCTGCACATTGGTtagactgggcaagggacagca ***** ********************************************************************************************* **** (((.((.....((((((((.(((...(((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)))))))...))).)))).))))))))). -43.00 (((...((...((((((((.(((...(((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)))))))...))).)))).))))))))). -43.20 ....((((...((((((((.(((...(((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)))))))...))).)))).)))))))).. -44.40 ....(((....((((((((.(((...(((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)))))))...))).)))).)))).))).. -41.90 # aligned and folded structure .***** *********.**********************************..******** .gcttctggagatcct.gctccgtcgccccagtgttcagactacctgttca..ggacaatg .gcttcaggagatcct.gctccgtcgccccagtgttcagactacctgttca..ggacaatg .gcttctggagatcct.gctccgtcgccccagtgttcagactacctgttca..ggacaatg .gcttctggagatcct.gctccgtcgccccagtgttcagactacctgttca..ggacaatg ||| || |||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||| || || 444 12 4444 4444 444 4444444 44444444 444 44 44 ||| || |||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||| || || acga.ca.....gggaacgggtcagatTGGTTACACGTCTGATG.ACATGttgcc...... acga.cc.....gggaacgggtcagatTGGTTACACGTCTGATG.ACATGttgcc...... acga.cc.....gggaacgggtcagatTGGTTACACGTCTGATG.ACATGttgcc...... acga.ga.....gggaacgggtcagatTGGTTACACGTCTGATG.ACATGttgcc...... ****. .....********************************.**********...... >PREDICTED_MIR16 chr7 99336252 99336356 - 16.481 hsa-mir-106b gctccagccctgccggggctAAAGTGCTGACAGTGCAGATAGtggtcctctccgtgctaccgcactgtgggtacttgctgctccagcagggcacgcacagcgtcc ac--cagccctgctgggactAAAGTGCTGACAGTGCAGATAGtggtcctctctgtgctaccgcactgtgggtacttgctgctccagcagggcacgtgcaacgccc ac--cagccctgctgggactAAAGTGCTGACAGTGCAGATAGtggtcctctctgtgctaccgcactgtgggtacttgctgctccagcagggcacatgcaacaccc actcaggccctgccggtgctAAAGTGCTGACAGTGCAGATAGcggtcctc--cgtgctaccgcactgtgggtacttgctgctccggcagggcacgcacggcgttc * ******* ** ************************ ******* ******************************* ********* * * * (((...(((((((.(((((..(((((((.(((((((...((((((......))..))))..))))))).)))))))...))))).)))))))......))).... -53.20 ..--..(((((((((((....(((((((.(((((((.....(((((.........))))).))))))).))))))).....)))))))))))............. -48.00 ..--..(((((((((((....(((((((.(((((((.....(((((.........))))).))))))).))))))).....)))))))))))............. -48.00 ......((((((((((.((..(((((((.(((((((.....((((....)--)))......))))))).)))))))...)).))))))))))............. -57.50 # aligned and folded structure .... * ...******* ** ***.********************* ..******* ....gctcca...gccctgccggggctA.AAGTGCTGACAGTGCAGATAGt..ggtcctct ....ac--ca...gccctgctgggactA.AAGTGCTGACAGTGCAGATAGt..ggtcctct ....ac--ca...gccctgctgggactA.AAGTGCTGACAGTGCAGATAGt..ggtcctct ....actcag...gccctgccggtgctA.AAGTGCTGACAGTGCAGATAGc..ggtcctc- ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| || 122 23 4444444344324 4444444 4444444 4 4444 43 ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| || cttgcggcacgcacgggacggcctcgtcgttcatgggtgtcacgcc.atcgtgc-...... cccacaacgtacacgggacgacctcgtcgttcatgggtgtcacgcc.atcgtgtc...... cccgcaacgtgcacgggacgacctcgtcgttcatgggtgtcacgcc.atcgtgtc...... cctgcgacacgcacgggacgacctcgtcgttcatgggtgtcacgcc.atcgtgcc...... * * * ********* *************************.****** ...... >PREDICTED_MIR17 chr17 24212670 24212774 - 16.440 hsa-mir-144 ctgtgcccccagtggggccctggctgggatatcatcatatactgtaagtttgcgatgagacaCTACAGTATAGATGATGTACTAgtccgggcacccccagctctg ct---cctccag---gaccttggctgggatatcatcatatactgtaagtttgtgatgagacaCTACAGTATAGATGATGTACTAgtctgggtaccc-cacctcca ct---cctccag---ggccttggctgggatatcatcatatactgtaagtttgtgatgagacaCTACAGTATAGATGATGTACTAgtctgggtaccc-caagacta ctgtgcctgctgcggggccctggctaggatatcatcatatactgtaagtttgcgacaagataCTACAGTATAGATGATGTACTAgtccgggtccccacagctctg ** ** * * * ** ***** ************************** ** *** ************************** *** *** ** * .............(((((((.((((((.((((((((.(((((((((.((((......))))..))))))))))))))))).)))))).)))).)))......... -44.40 ..---......(---(((((.((((((.((((((((.(((((((((.((((......))))..))))))))))))))))).)))))).)))).)).-........ -37.30 ..---......(---(((((.((((((.((((((((.(((((((((.((((......))))..))))))))))))))))).)))))).)))...))-)....... -37.50 ........((((.(((((((.((((((.((((((((.(((((((((.((((......))))..))))))))))))))))).)))))).))).)))).)))).... -52.30 # aligned and folded structure ** ** * * *. ** ***** *********************.***** ** ctgtgcccccagtggg.gccctggctgggatatcatcatatactgtaa.gtttgcgatg ct---cctccag---g.accttggctgggatatcatcatatactgtaa.gtttgtgatg ct---cctccag---g.gccttggctgggatatcatcatatactgtaa.gtttgtgatg ctgtgcctgctgcggg.gccctggctaggatatcatcatatactgtaa.gtttgcgaca | | |||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| 2 2 2214 224 4444 444444 44444444 444444444 4444 | | |||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| gtct....cgacacccctgggcctgATCATGTAGTAG.ATATGACATCataga...... atca....gaac-cccatgggtctgATCATGTAGTAG.ATATGACATCacaga...... acct....ccac-cccatgggtctgATCATGTAGTAG.ATATGACATCacaga...... gtct....cgacccccacgggcctgATCATGTAGTAG.ATATGACATCacaga...... * .... ** *** *** ***************.*********** ***...... >PREDICTED_MIR18 chr6 52117094 52117198 + 16.437 hsa-mir-206 tctggatgac------------------------actgcttcccgaggccacatgcttctttatatccccatatggattactttgcTATGGAATGTAAGGAAGTGTGTggtttcggcaagtgcctcctc tc-ggaggac------------------------acagcttccccaggccacatgcttctttatatcctcatagatatctcagcacTATGGAATGTAAGGAAGTGTGTggttttggcaagtgcttcttc tc-ggaggac------------------------acctcttccccaggccacatgcttctttatatcctcatagatatcactgcgcTATGGAATGTAAGGAAGTGTGTggttttggcaagtgcttcttc tctggatgacaggagaagccaggccagggccaagactgcttcccgaggccacatgcttctttatatccccatacggattacgttgcTATGGAATGTAAGGAAGTGTGTggtttcggcaagtgcctcttc ** *** *** ** ****** *********************** **** ** * **************************** ********* ** ** ...(((...(------------------------(((.....((((((((((((((((((((((((..(((((..((.....))..))))).))))))))))))))))))))))))..))))..))).. -45.50 ..-((((((.------------------------...((((.((.(((((((((((((((((((((..((((((...........)))))).))))))))))))))))))))).)).))))..)))))) -41.40 ..-(((((.(------------------------((...((.((.(((((((((((((((((((((..((((((...........)))))).))))))))))))))))))))).)).)))))))))).. -39.60 ...........(((((.((..................((((.((((((((((((((((((((((((..(((((((.....)))....)))).)))))))))))))))))))))))).)))))).))))) -47.76 # aligned and folded structure ** *** **.* ** ****** *********************** **** ** * tctggatga.c------------------------actgcttcccgaggccacatgcttctttatatccccatatggattact tc-ggagga.c------------------------acagcttccccaggccacatgcttctttatatcctcatagatatctca tc-ggagga.c------------------------acctcttccccaggccacatgcttctttatatcctcatagatatcact tctggatga.caggagaagccaggccagggccaagactgcttcccgaggccacatgcttctttatatccccatacggattacg ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || 444 2 4 442 4 442444444444444444444444 444442 22 ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ct.tct..ccg........................tga...acggctttggTGTGTGAAGGAATGTAA.GGTATcgtt..... ct.tct..tcg........................tga...acggttttggTGTGTGAAGGAATGTAA.GGTATcgcg..... ct.tct..tcg........................tga...acggttttggTGTGTGAAGGAATGTAA.GGTATcacg..... ct.cct..ccg........................tga...acggctttggTGTGTGAAGGAATGTAA.GGTATcgtt..... **. **.. **........................***...**** **********************.****** ..... >PREDICTED_MIR19 chr1 1142400 1142504 + 16.101 hsa-mir-200b cccggacccagc-tcgggcagccgtggccatcttactgggcagcattggatggagtcaggtctCTAATACTGCCTGGTAATGATGacggcggagccctgcacgcag tccatatccaac-ttgggcagccgtggccatcttactgggcagcattggatagtgtctgatctCTAATACTGCCTGGTAATGATGacggcggagccctgcatgcag tccatatccaac-ttgggcagccgtggccatcttactgggcagcattggatagtgtctgatctCTAATACTGCCTGGTAATGATGacggcggagccctgcacgcag cccagacccaatagggggcggccatcgccatcttactgggcagcattggatggtgtcaggtctCTAATACTGCCTGGTAATGATGacggcggggccctgcgcgcaa ** * *** **** *** * ************************* * *** * ******************************** ******* *** ..........((-..((((.(((((...((((((((..(((((.((((((.((.......)))))))).)))))..)))).)))))))))...)))).))...... -43.60 ............-..((((.(((((...((((((((..(((((.((((((............)))))).)))))..)))).)))))))))...))))......... -40.60 ............-..((((.(((((...((((((((..(((((.((((((............)))))).)))))..)))).)))))))))...))))......... -40.60 .................((((((.((((((((((((..(((((.((((((.((.......)))))))).)))))..)))).)))...)))))))))..))...... -39.50 # aligned and folded structure ** * *** **** ..*** * ******.******************* * *** * cccggacccagc-tcgggca..gccgtggccatc.ttactgggcagcattggatggagtcagg tccatatccaac-ttgggca..gccgtggccatc.ttactgggcagcattggatagtgtctga tccatatccaac-ttgggca..gccgtggccatc.ttactgggcagcattggatagtgtctga cccagacccaatagggggcg..gccatcgccatc.ttactgggcagcattggatggtgtcagg | | ||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| || 3 2 141 4444 44434 4444 44444444444 444444 24 | | ||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| || aacgcg....cgt..cccggggcggca...GTAGTAATGGTCCGTCATAATCt.ct....... gacgca....cgt..cccgaggcggca...GTAGTAATGGTCCGTCATAATCt.ct....... gacgta....cgt..cccgaggcggca...GTAGTAATGGTCCGTCATAATCt.ct....... gacgca....cgt..cccgaggcggca...GTAGTAATGGTCCGTCATAATCt.ct....... *** ....***..**** *******...***********************.**....... >PREDICTED_MIR20 chr17 76714260 76714364 + 16.002 hsa-mir-338 ggaggctggcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctggagtcgcctgagtcatcactCAGCACCAGGATATTGTTGGAGaggacagccgtgcggcgtctg ggaggctggcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctggagtca-ctgtgcacccactCAGCACCAGGATATTGTTGGGGaggacggccgtgcagcgt-tg ggaggctggcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctggagtca-ctgtgcacccactCAGCACCAGGATATTGTTGGGGaggacggccgggcagcgt-cg ggaggctggcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctggagttgcatgtgtcatcactCAGCACCAGGATATTGTTGGGGaggacggccgtgcggcgtccg ********************************************** ** * ************************ ****** **** ** **** * (((.((((((.((((.((((((((((((.(((.(((.(((((((.((....)).))......))))).)))))).)))))))))))).)))).)).)))).))). -50.90 .((.((((((.((((.((((((((((((.(((.(((.(((((.(((..-..........)))))))).)))))).)))))))))))).)))).)).)))).)-). -47.30 .((.(((.((.((((.((((((((((((.(((.(((.(((((.(((..-..........)))))))).)))))).)))))))))))).))))...))))).)-). -47.70 (((.((((((.((((.((((((((((((.(((.(((.(((((.((.((.(((...)))))))))))).)))))).)))))))))))).)))).)).)))).))). -53.10 # aligned and folded structure .********.**********************************......**** * .ggaggctg.gcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctg......gagtcgcct .ggaggctg.gcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctg......gagtca-ct .ggaggctg.gcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctg......gagtca-ct .ggaggctg.gcagctgccctcttcaacaaaatcactgatgctg......gagttgcat ||| |||| || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| || || 424 4444 34 4444 444444444444 444 444 44444 22 14 ||| |||| || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| || || gcctgcggcgtgccggcaggaGGGGTTGTTATAG.GACCACGACtcactactgtg.... gc-tgcgacgggccggcaggaGGGGTTGTTATAG.GACCACGACtcacccacgtg.... gt-tgcgacgtgccggcaggaGGGGTTGTTATAG.GACCACGACtcacccacgtg.... gtctgcggcgtgccgacaggaGAGGTTGTTATAG.GACCACGACtcactactgag.... * **** ** **** ****** ***********.************* * *.... >PREDICTED_MIR21 chr7 130019461 130019565 - 15.986 hsa-mir-29b-1 atcataaagcttcttcaggaagctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgattgtcTAGCACCATTTGAAATCAGTGTtcttgggggagaccagctgcg acgacaaagcttcttcaggaagctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgattgtcTAGCACCATTTGAAATCAGTGTtcttggtggagaactacttcg ac---aaagcttcttcaggaagctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgattgtcTAGCACCATTTGAAATCAGTGTtcttggtggagaacaacttcg atcataaagcttcttcaggaagctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgattgtcTAGCACCATTTGAAATCAGTGTtcttgggggaggccagctgca * ************************************************************************************* **** * ** * .........((((((((((((((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).)))))))))).)))))))))))).......... -38.92 .(((.....((((.(((((((((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).)))))))))).))))))).)))).......))) -35.92 ..---....((((.(((((((((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).)))))))))).))))))).)))).......... -35.22 .........((((((((((((((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).)))))))))).)))))))))))).......... -39.12 # aligned and folded structure * ****..************.************************************** atcataaag..cttcttcaggaa.gctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgatt acgacaaag..cttcttcaggaa.gctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgatt ac---aaag..cttcttcaggaa.gctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgatt atcataaag..cttcttcaggaa.gctggtttcatatggtggtttagatttaaatagtgatt ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| 411 14 444424444444 4444444444 444444 444444 ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| .acgtcgaccggagggggttctTGTGACTAAAGTTTACCAC..GATctg............. .gcttcaacaagaggtggttctTGTGACTAAAGTTTACCAC..GATctg............. .gcttcatcaagaggtggttctTGTGACTAAAGTTTACCAC..GATctg............. .gcgtcgaccagagggggttctTGTGACTAAAGTTTACCAC..GATctg............. . * ** * **** *************************..******............. >PREDICTED_MIR22 chr7 129008695 129008799 - 15.971 hsa-mir-183 agtgtgactcctgttctgtgTATGGCACTGGTAGAATTCACTgtgaacagtctcagtcagtgaattaccgaagggccataaacagagcagagacagatccacgag agtgtgactcctgtcctgtgTATGGCACTGGTAGAATTCACTgtgaacagtctcagtcagtgaattaccgaagggccataaacagagcagagacagatccgcgag agtgtgactcctgtcctgtgTATGGCACTGGTAGAATTCACTgtgaacagtctcggtcagtgaattaccgaagggccataaacagagcagagacagatccgcgag agcgtgactcctgttctgtgTATGGCACTGGTAGAATTCACTgtgaacagtctcggtcagtgaattaccgaagggccataaacagagcagagacagatccgcgag ** *********** *************************************** ********************************************* **** .(((.((.(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).))....)))))... -41.90 .(((.((.(((((..((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))..))).))....)))))... -38.00 .(((.((.(((((..((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))..))).))....)))))... -37.30 .(((.((.(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).))....)))))... -42.70 # aligned and folded structure *..* *****...**.**** *************..***************..********* a..gtgtgac...tc.ctgttctgtgTATGGCAC..TGGTAGAATTCACTg..tgaacagtc a..gtgtgac...tc.ctgtcctgtgTATGGCAC..TGGTAGAATTCACTg..tgaacagtc a..gtgtgac...tc.ctgtcctgtgTATGGCAC..TGGTAGAATTCACTg..tgaacagtc a..gcgtgac...tc.ctgttctgtgTATGGCAC..TGGTAGAATTCACTg..tgaacagtc ||| || || ||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||| 444 44 44 444424444 444444 4 44444 44444444 444 ||| || || ||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||| gagcgc.ctagacagagacgagacaaataccgggaagccat..taagtgactggct...... gagcgc.ctagacagagacgagacaaataccgggaagccat..taagtgactggct...... gagcgc.ctagacagagacgagacaaataccgggaagccat..taagtgactgact...... gagcac.ctagacagagacgagacaaataccgggaagccat..taagtgactgact...... **** *.**********************************..********** **...... >PREDICTED_MIR23 chr14 100591491 100591595 + 15.924 ccagtgt-------------tcatgtgtggtacttggagagaggctggccgtgatgaattcgattcatcaaagcgAGTCATACACGGCTCTCCTCTCttttagtgtcaaattctgcct ccagtgttcttcgccagtgatcatgtgtgatacttggagagaggctggccgtgatgaattcgattcatctaaacgAGTCATACACGGCTCTCCTCTCttctagtgtcaaactctgcct ccagtga-------------tcatgtgtgatacttggagagaggctggccgtgatgaattcgattcatctaaacgAGTCATACACGGCTCTCCTCTCttctagtgtcaaactctacct ccagcct-------------tcacttatggtacttgaagagaggctggccgtgatgaattcgattcatcaaagcgAGTCATACACGGCTCTCCTCTCttttagtgtcaaattctgcct **** *** * ** ****** ******************************** ** ************************** ********** *** *** ..((.((-------------.......((..(((..((((((((..(((((((((((.((((...........)))))))).)))))))..))))))))..)))..))......)))) -40.22 ........................((.(((((((.(((((((((..(((((((((((.((((...........)))))))).)))))))..))))))))).))))))).))....... -44.60 .......-------------....((.(((((((.(((((((((..(((((((((((.((((...........)))))))).)))))))..))))))))).))))))).))....... -44.60 .......-------------.......((..(((.(((((((((..(((((((((((.((((...........)))))))).)))))))..))))))))).)))..)).......... -39.90 # aligned and folded structure **** *** * ** ****** ****************.**************** ** ccagtgt-------------tcatgtgtggtacttggagagaggctggccgtg.atgaattcgattcatcaaag ccagtgttcttcgccagtgatcatgtgtgatacttggagagaggctggccgtg.atgaattcgattcatctaaa ccagtga-------------tcatgtgtgatacttggagagaggctggccgtg.atgaattcgattcatctaaa ccagcct-------------tcacttatggtacttgaagagaggctggccgtg.atgaattcgattcatcaaag || || || ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| 44 33 34 4444444 444444444 4444444 4444 4444 || || || ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ..tc.cgtct..............taaactgtgattttCTCTCCTCTCGGCACATACT.GAgc........... ..tc.catct..............caaactgtgatcttCTCTCCTCTCGGCACATACT.GAgc........... ..tc.cgtct..............caaactgtgatcttCTCTCCTCTCGGCACATACT.GAgc........... ..tc.cgtct..............taaactgtgattttCTCTCCTCTCGGCACATACT.GAgc........... ..**.* ***.............. ********** **********************.****........... >PREDICTED_MIR24 chr1 98223649 98223753 - 15.668 hsa-mir-137 agcttggtcctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataatacggattacgttGTTATTGCTTAAGAATACGCGTagtcgaggagagtaccagcgg agcttggccctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataatacggattacgttGTTATTGCTTAAGAATACGCGTagtcgaggagagtaccagcgg agcttggccctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataatacggattacgttGTTATTGCTTAAGAATACGCGTagtcgaggagagtaccagcgg agcttggtcctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataatacggattacgttGTTATTGCTTAAGAATACGCGTagtcgaggagagtaccagcgg ******* ************************************************************************************************* .(((.(((......(((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..))))))))))))))))).. -48.70 ........((.((((((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))..))).)) -47.40 ........((.((((((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))..))).)) -47.40 .(((.(((......(((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..))))))))))))))))).. -48.70 # aligned and folded structure *.****** *******************************************.******* a.gcttggtcctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataata.cggatta a.gcttggccctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataata.cggatta a.gcttggccctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataata.cggatta a.gcttggtcctctgactctcttcggtgacgggtattcttgggtggataata.cggatta ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || 444 442 444444444444 444 4444444444444 444444 44 ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ggcga.cca......tgagaggagctgaTGCGCATAAGAATTCGT.TATTGttgc..... ggcga.cca......tgagaggagctgaTGCGCATAAGAATTCGT.TATTGttgc..... ggcga.cca......tgagaggagctgaTGCGCATAAGAATTCGT.TATTGttgc..... ggcga.cca......tgagaggagctgaTGCGCATAAGAATTCGT.TATTGttgc..... *****.***......******************************.*********..... >PREDICTED_MIR25 chr1 153203193 153203303 - 15.623 hsa-mir-9-1 gccaggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggagtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaataaccccatacactgcgcaga gccaggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggagtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaataaccccatacactgcgcaga gccaggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggagtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaataaccccatacactgcgcaga gccaggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggagtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaataaccccatacactgcgcaga *************************************************************************************************************** (((((.....(((((((....(((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..)))...))))))).....))).))... -47.40 (((((.....(((((((....(((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..)))...))))))).....))).))... -47.40 (((((.....(((((((....(((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..)))...))))))).....))).))... -47.40 (((((.....(((((((....(((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..)))...))))))).....))).))... -47.40 # aligned and folded structure ...**.******************************************************** ...gc.caggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggag ...gc.caggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggag ...gc.caggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggag ...gc.caggaggcggggttggttgttaTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGagtggtgtggag || ||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| || 44 444 4 4444444 44 4444 444444444444444 444444 44 || ||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| || agacgcgtcacataccccaataaa.aatgaaagccaatagatcgaaatactt.ct....... agacgcgtcacataccccaataaa.aatgaaagccaatagatcgaaatactt.ct....... agacgcgtcacataccccaataaa.aatgaaagccaatagatcgaaatactt.ct....... agacgcgtcacataccccaataaa.aatgaaagccaatagatcgaaatactt.ct....... ************************.***************************.**....... >PREDICTED_MIR26 chr14 100601988 100602092 + 15.612 ccgatggcactctgggtacctgagaagaggttgtctgtgatgagttcgcttttattaatgacGAATATAACACAGATGGCCTGTtttcagtaccgct----------accgcccg --------acactgggtacttgaggagaggttgtctgtgatgagttcgc-tttattaatgacGAATATAACACAGATGGCCTGTtttcaataccacctgccactccggtcactcg --------acactgggtacttgaggagaggttgtctgtgatgagttcgc-tttattaatgacGAATATAACACAGATGGCCTGTtttcaataccacctgccactcctgtcacttg acggcgtctctttgggtacttgaggagaggttgtctgtgatgagttcgc-tttattaatgccGAATATAACACAGATGGCCTGTtttcggtaccccct---------gcgactct * ******* **** ************************ ********** *************************** **** * * .....(((......(((((.((((((.((((..((((((.((.(((((.((........))))))).)).))))))..)))).)))))))))))...----------...))).. -41.30 --------......((((.(((((((.((((..((((((.((.(((((.-((.......))))))).)).))))))..)))).)))))))))))..................... -35.20 --------......((((.(((((((.((((..((((((.((.(((((.-((.......))))))).)).))))))..)))).)))))))))))..................... -35.20 ..((.(((.....(((((((.(((((.((((..((((((.((.((((((-.........)).)))).)).))))))..)))).))))))))))))...---------..))).)) -43.00 # aligned and folded structure * *..........****** **** ************************ ********* ccgatggcactct..........gggtacctgagaagaggttgtctgtgatgagttcgcttttattaat --------acact..........gggtacttgaggagaggttgtctgtgatgagttcgc-tttattaat --------acact..........gggtacttgaggagaggttgtctgtgatgagttcgc-tttattaat acggcgtctcttt..........gggtacttgaggagaggttgtctgtgatgagttcgc-tttattaat || |||| || |||||| |||||| |||||||||||| || ||||| || 11 2111 21 144442 444444 444444444444 44 44444 14 || |||| || |||||| |||||| |||||||||||| || ||||| || ..tc.tcagcg---------tcccccatg.gctttTGTCCGGTAGACACAATATAAGc.cg........ ..gt.tcactgtcctcaccgtccaccata.actttTGTCCGGTAGACACAATATAAGc.ag........ ..gc.tcactggcctcaccgtccaccata.actttTGTCCGGTAGACACAATATAAGc.ag........ ..gc.ccgcca----------tcgccatg.actttTGTCCGGTAGACACAATATAAGc.ag........ .. . * * **** . ***************************. *........ >PREDICTED_MIR27 chr15 87712243 87712353 + 15.442 hsa-mir-9-3 ctggctaa-gggaggcccgtttctctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacagagccgtcataaagctagataaccgaaagtagaaatgattctcacaacttctgcgt ccggcgaatgggaggcccgtttctctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacagagccgtcataaagctagataaccgaaagtagaaatgactctcacaacttctgcgt ccggcgaatgggaggcccgtttctctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacagagccgtcataaagctagataaccgaaagtagaaatgactctaacaacttctgcgt gtggcgaa-gggaggcccgtttctctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacagagccgtcataaagctagataaccgaaagtagaaatgactctcacaacttctgcgt *** ** ************************************************************************************* *** ************* ...((.((-(.((((..(((((((((.(((((((((((((((.(((((..((......))..))))).))))))))))))))))).)))))))..))))....)))..)).. -44.30 ...(((((((((((...(((((((((.(((((((((((((((.(((((..((......))..))))).))))))))))))))))).))))))).))))))....))).)).. -45.90 ...(((((((..(((..(((((((((.(((((((((((((((.(((((..((......))..))))).))))))))))))))))).)))))))..)))..))..))).)).. -43.20 ...(((((-(.((((..(((((((((.(((((((((((((((.(((((..((......))..))))).))))))))))))))))).)))))))..))))....)))).)).. -47.40 # aligned and folded structure ***. ** **...*************.********************************** ctggc.taa-gg...gaggcccgtttct.ctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacaga ccggc.gaatgg...gaggcccgtttct.ctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacaga ccggc.gaatgg...gaggcccgtttct.ctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacaga gtggc.gaa-gg...gaggcccgtttct.ctCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAgtgccacaga || || ||| | |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| || 14 44 344 4 3444 4444444 44 444444444444444 44444 44 || || ||| | |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| || tg.cgtctt.caacactctcagtaaagatga.aagccaatagatcgaaatactgccg...... tg.cgtctt.caacaatctcagtaaagatga.aagccaatagatcgaaatactgccg...... tg.cgtctt.caacactctcagtaaagatga.aagccaatagatcgaaatactgccg...... tg.cgtctt.caacactcttagtaaagatga.aagccaatagatcgaaatactgccg...... **.******.***** *** ***********.*************************...... >PREDICTED_MIR28 chr8 135886278 135886388 - 15.401 hsa-mir-30d ttcttgttcagaaagtctgttgttGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtgtaagacacagctaagctttcagtcagatgtttgctgctaccggctattcacagacatcctctt tgctg--tcagaaagtctgtgtctGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtgtaagccacagccaagctttcagtcagatgtttgctgctactggctcttcgaatgcatcttttg tgctg--tcagaaagtctgtgtctGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtgtaagccacagccaagctttcagtcagatgtttgctgctactggctcttcgcatgcatcttttg tgtgg-ttgagaaagcctgtggttGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtggaag--acagcaaagctttcagtcagatgtttgctgctaccggctgttcacagacggcacttg * * ****** **** ************************* *** ***** **************************** **** *** * * * * ....((((..(((((((.((.((.(((((((((...(((((((((((...((......)).))))))))))).))))))))).)).)).)))).)))...))))....... -37.00 (((..--((.(((((((.(((.(.(((((((((...(((((((((((....((....))..))))))))))).))))))))).).))).)))).)))))..)))....... -39.30 (((((--(..(((((((.(((.(.(((((((((...(((((((((((....((....))..))))))))))).))))))))).).))).)))).)))))).)))....... -39.70 (((.(-((..(((((((.(((((.(((((((((...(((((((((((.....--.......))))))))))).))))))))).))))).)))).)))...))).))).... -47.90 # aligned and folded structure ....* *.. ****.** **** ************************* *** *** ....ttcttgtt..cagaa.agtctgttgttGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtgtaagacaca ....tgctg--t..cagaa.agtctgtgtctGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtgtaagccaca ....tgctg--t..cagaa.agtctgtgtctGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtgtaagccaca ....tgtgg-tt..gagaa.agcctgtggttGTAAACATCCCCGACTGGAAGCtggaag--aca ||| |||| | ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| 131 1122 2 444 4444 44324 444444444 44444444444 142 ||| |||| | ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| gttcacg.gcagaca.cttgtcggccatcgtcgtttgtaga..ctgactttcgaa..acg.... gttttct.acgtacg.cttctcggtcatcgtcgtttgtaga..ctgactttcgaa..ccg.... gttttct.acgtaag.cttctcggtcatcgtcgtttgtaga..ctgactttcgaa..ccg.... ttctcct.acagaca.cttatcggccatcgtcgtttgtaga..ctgactttcgaa..tcg.... * * . * * .*** **** ****************..************.. **.... >PREDICTED_MIR29 chr22 44830079 44830183 + 15.152 hsa-let-7b gcctggcggggtgaggtagtaggttgtgtggtttcagggcagtgatgttg-cccctcggaagaTAACTATACAACCTACTGCCTTccctgaggagcccagtgacac acaccgcagggtgaggtagtaggttgtgtggtttcagggcagtgatgttg-cccctccgaagaTAACTATACAACCTACTGCCTTccctgaggcgcccagggacac acaccgcggggtgaggtagtaggttgtgtggtttcagggcagtgatgtcg-cccctccgaagaTAACTATACAACCTACTGCCTTccctgaggcgcccagggacac caccggcggggtgaggtagtaggttgtgtggtttcagggcagtgatgttgccccctcggaagaTAACTATACAACCTACTGCCTTccccgaggagcccagcgacac ** **************************************** * ****** ****************************** **** ****** ***** ((((..(((((.(((((((((((((((((((((...((((((.....)))-)))..........)))))))))))))))))))))))))).)).)).......... -51.32 ...((.(((((.(((((((((((((((((((((((.((((((.....)))-)))....))....)))))))))))))))))))))))))).))............. -52.00 ...((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((..(((....))-))))).....)).)))))))))))))))))))))))))).))............. -50.60 ..((..(((((.(((((((((((((((((((((...((((((.....))))))...........)))))))))))))))))))))))))).))............. -53.34 # aligned and folded structure .......... . ** *************************....**..*.***.******** ..........gc.ctggcggggtgaggtagtaggttgtgtggtt....tc..a.ggg.cagtgatg ..........ac.accgcagggtgaggtagtaggttgtgtggtt....tc..a.ggg.cagtgatg ..........ac.accgcggggtgaggtagtaggttgtgtggtt....tc..a.ggg.cagtgatg ..........ca.ccggcggggtgaggtagtaggttgtgtggtt....tc..a.ggg.cagtgatg || || ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||| 13 24 44444 444444444444444444444 44 4 444 434 || || ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||| cacagcgacccgagga.gcccc.TTCCGTCATCCAACATATCAATagaaggctcccccgtt..... cacagggacccgcgga.gtccc.TTCCGTCATCCAACATATCAATagaagcctcccc-gct..... cacagggacccgcgga.gtccc.TTCCGTCATCCAACATATCAATagaagcctcccc-gtt..... cacagtgacccgagga.gtccc.TTCCGTCATCCAACATATCAATagaaggctcccc-gtt..... ***** ****** ***.* ***.*************************** ****** * *..... >PREDICTED_MIR30 chr1 151978032 151978142 + 15.126 NEW_AND_VALIDATED gcgggatccc-gggccccgggcgggcgggagggacgggacgcggtgcagtgttgttttttcccccgccaatATTGCACTCGTCCCGGCCTCCGgcccccccggccccccggc gcgggattccagagccccgggtgggcgggagggacgggacgtggtgcagtgttgttctttcccctgccaatATTGCACTCGTCCCGGCCTCCGgccccctcggcccccccgg gcgggattccagagccccgggtgggcaggagggacgggacgcggtgcagtgttgttctttcccctgccaatATTGCACTCGTCCCGGCCTCCGgccccctcggcccccccgg gcgggatccc-gggccccgggtgggcgggagggacgggacgcggtgcagtgttgttctctcccccgccaatATTGCACTCGTCCCGGCCTCCGgcccccccggccccccggc ******* ** * ******** **** ************** ************** * ***** ********************************** ********* * .((((.....-(((((..(((.((((.(((((..(((((((.((((((((((((.............))))))))))))))))))).))))).))))))).))))))))).. -72.32 .((((......(.(((..(((.((((.(((((..(((((((.((((((((((((.............))))))))))))))))))).))))).))))))).))))..)))). -62.92 .((((......(.(((..(((.((((.(((((..(((((((.((((((((((((.............))))))))))))))))))).))))).))))))).))))..)))). -61.12 .((((.....-(((((..(((.((((.(((((..(((((((.((((((((((((.............))))))))))))))))))).))))).))))))).))))))))).. -72.32 # aligned and folded structure *.****** ** * ******** **** ************** ************** * ***** ** g.cgggatccc-gggccccgggcgggcgggagggacgggacgcggtgcagtgttgttttttcccccgc g.cgggattccagagccccgggtgggcgggagggacgggacgtggtgcagtgttgttctttcccctgc g.cgggattccagagccccgggtgggcaggagggacgggacgcggtgcagtgttgttctttcccctgc g.cgggatccc-gggccccgggtgggcgggagggacgggacgcggtgcagtgttgttctctcccccgc | |||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| 2 2444 42444 444 4444 44444 4444444 444444444444 | |||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| cggccc......cccggc.ccc.cccgGCCTCCG.GCCCTGC.TCACGTTAtaac............. ggcccc......cccggc.tcc.cccgGCCTCCG.GCCCTGC.TCACGTTAtaac............. ggcccc......cccggc.tcc.cccgGCCTCCG.GCCCTGC.TCACGTTAtaac............. cggccc......cccggc.ccc.cccgGCCTCCG.GCCCTGC.TCACGTTAtaac............. * ***......******. **.***********.*******.************............. >PREDICTED_MIR31 chr12 52671794 52671898 + 15.097 hsa-mir-196a-2 gctcagctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagttttgaactcggcaacaagaaactgcctgagttacatcagtcggttttcgtcgagggc gctcagctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagttttgaactcggcaacaagaaactgcctgagttacatcagtcggttttcgtcgagggc gctcagctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagttttgaactcggcaacaagaaactgcctgagttacatcagtcggttttcgtcgagggc gctcagctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagttttgaactcggcaacaagaaactgcctgagttacatcagtcggttttcgtcgagggc ********************************************************************************************************* ((((.(((((..((((((((((((((((((.((((((((((.((((...)))).)))))))))).))))))))))))))))))))))).............)))) -45.04 ((((.(((((..((((((((((((((((((.((((((((((.((((...)))).)))))))))).))))))))))))))))))))))).............)))) -45.04 ((((.(((((..((((((((((((((((((.((((((((((.((((...)))).)))))))))).))))))))))))))))))))))).............)))) -45.04 ((((.(((((..((((((((((((((((((.((((((((((.((((...)))).)))))))))).))))))))))))))))))))))).............)))) -45.04 # aligned and folded structure *****............******************************************** gctca............gctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagtt gctca............gctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagtt gctca............gctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagtt gctca............gctgatctgtggcttAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGAttgagtt |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| 4444 44444 444444444444444444 4444444444 4444 |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| cgggagctgcttttggctgact..acattgagtccgtcaaagaacaacggctcaagtt... cgggagctgcttttggctgact..acattgagtccgtcaaagaacaacggctcaagtt... cgggagctgcttttggctgact..acattgagtccgtcaaagaacaacggctcaagtt... cgggagctgcttttggctgact..acattgagtccgtcaaagaacaacggctcaagtt... **********************..**********************************... >PREDICTED_MIR32 chr11 110888859 110888969 - 15.022 hsa-mir-34b cggcgg-tgatgctgtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAGTGATTGTaaccaccacagtacaatcagctaatgacactgcctacaaaccgagcaccgggcacccgcgg-c cggcgggtgatgctgtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAGTGATTGTcagcaccgcactacaatcagctaattacactgcctacaaaccgagcaccgggcgcccgcca-c cggcgggtgatgctgtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAGTGATTGTcagcaccgcactacaatcagctaattacactgcctacaaaccgagcaccgggcgcccgccg-c cggcgggtgatgctgtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAGTGATTGTaagcagcagaggacaatcagctaattacactgcctacaaaccgagcaccgggcgcccgcgggc ****** ******************************************* * ** * * ************* *************************** ***** * (.((((-.(.((((((((.(((.((((..(((((((..(((((((((((((..........)))))))).)))))..)))))))..)))).)))))))..))))))))).)-. -49.30 .((((((((.(.(.((((.(((.((((..(((((((.(((((((((((((.((.......))))))))).)))))).)))))))..)))).))))))).).))))))))).-. -55.40 (((((((((.(.(.((((.(((.((((..(((((((.(((((((((((((.((.......))))))))).)))))).)))))))..)))).))))))).).))))))))))-. -56.20 (.(((((((.(.(.((((.(((.((((..(((((((.(((((((((((((...(....)...))))))).)))))).)))))))..)))).))))))).).)))))))).).. -53.40 # aligned and folded structure ..****** *******..*****************************.******* * .** * ..cggcgg-tgatgct..gtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAG.TGATTGTaac.cacca ..cggcgggtgatgct..gtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAG.TGATTGTcag.caccg ..cggcgggtgatgct..gtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAG.TGATTGTcag.caccg ..cggcgggtgatgct..gtgccttgttttgaTGGCAGTGGAGTTAG.TGATTGTaag.cagca |||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||| | | 324444 4 4444 4444 444 4444 4444444 344444 44444441 3 1 |||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||| | | cgggcgcc..c.gcgggccacg.agccaaacatccgtcacattaatcgactaacag.gag.... c-gccgcc..c.gcgggccacg.agccaaacatccgtcacattaatcgactaacat.cac.... c-accgcc..c.gcgggccacg.agccaaacatccgtcacattaatcgactaacat.cac.... c-ggcgcc..c.acgggccacg.agccaaacatccgtcacagtaatcgactaacat.gac.... * ****..*. *********.****************** ************* . * .... >PREDICTED_MIR33 chr5 87998416 87998520 - 15.018 hsa-mir-9-2 ctgtgtgggaagcgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaactccttcaagatcgccggg ttgtgagggaagcgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaactccttcaaggtcaccgag ttgtgagggaagcgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaactccttcaagatcaccgag gtgtgagggaagtgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtcttcataaagctagataaccgaaagtaaaaactccttcaagatcgccggg **** ****** *********************************************************************************** ** *** * (((.((((((((.(((((.(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..))).)))))))))....))))))). -43.80 ..((((..((((.(((((.(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..))).)))))))))....)))).... -43.10 ..((((..((((.(((((.(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..))).)))))))))....)))).... -44.20 ..((((..((((.(((((.(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..))).)))))))))....)))).... -43.80 # aligned and folded structure . **** **....**** ******************************************* .ctgtgtgg....gaagcgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtc .ttgtgagg....gaagcgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtc .ttgtgagg....gaagcgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtc .gtgtgagg....gaagtgagttgtTATCTTTGGTTATCTAGCTGTAtgagtgtattggtc ||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| 344 4144 4444 44444 4444 444444444444444 444444 ||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| gggc.cgctagaacttc.ctcaaaaatgaaagccaatagatcgaaatactt.......... gagc.cactagaacttc.ctcaaaaatgaaagccaatagatcgaaatactt.......... gagc.cactggaacttc.ctcaaaaatgaaagccaatagatcgaaatactt.......... gggc.cgctagaacttc.ctcaaaaatgaaagccaatagatcgaaatactt.......... * **.* ** *******.*********************************.......... >PREDICTED_MIR34 chr9 94017784 94017888 + 15.012 hsa-let-7a-1 ctcttcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagttttagggtcacacccaccactgggagATAACTATACAATCTACTGTCTttcctaacgtgatagaaaagt ctcttcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagttttagggtcacacccaccactgggagATAACTATACAATCTACTGTCTttcctaaggtgatggaaaagt gtcttcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagttttagggtcacacccaccactgggagATAACTATACAATCTACTGTCTttcctaaggtgatggaaaagt ctcttcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagttttagggtcacacccaccactgggagATAACTATACAATCTACTGTCTttcctaacgtgatagaaaaat ****************************************************************************************** ***** ***** * .(((((((..(((((.(((..((((((((((((((((...(((.....))).............))))))))))))))))..))))))))..)))).)))..... -39.69 .((((((((.(((((.(((..((((((((((((((((...(((.....))).............))))))))))))))))..)))))))).))))).)))..... -41.59 .((((((((.(((((.(((..((((((((((((((((...(((.....))).............))))))))))))))))..)))))))).))))).)))..... -41.69 .(((((((..(((((.(((..((((((((((((((((...(((.....))).............))))))))))))))))..))))))))..)))).)))..... -39.69 # aligned and folded structure ....***.************************************..........******** c....tct.tcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagtttta..........gggtcaca c....tct.tcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagtttta..........gggtcaca g....tct.tcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagtttta..........gggtcaca c....tct.tcactgtgggatgaggtagtaggttgtatagtttta..........gggtcaca | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| 1 444 44442 44444 444444444444444444444 4 444 | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| taaaaagatagtgcaatcct.tTCTGTCATCTAACATATCAATAgagggtcaccaccc..... tgaaaaggtagtggaatcct.tTCTGTCATCTAACATATCAATAgagggtcaccaccc..... tgaaaaggtagtggaatcct.tTCTGTCATCTAACATATCAATAgagggtcaccaccc..... tgaaaagatagtgcaatcct.tTCTGTCATCTAACATATCAATAgagggtcaccaccc..... * ***** ***** ******.*************************************..... >PREDICTED_MIR35 chr21 16833270 16833374 + 15.000 hsa-mir-99a caagatgttgcccattggcaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggaccgcacaagctcgcttctatgggtctgtgtcagtgtggtaatctgacaaaa tgagacgatgcccattgacaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggaccgcgcaagctcgtttctatgggtctgtggcagtgtggtgatctgacaaag tgggatgatgcccattggcaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggaccgcacaagctcgtttctatgggtctgtggcagtgtggtaatctgacagag tgagatgttgcccattggcaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggacggcacaagctcgcttctatgggtctgtgtcagtgtggtcatctaacaaaa ** * ********* ************************************* ** ******** *************** ********* **** *** * ..((((..((((((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).)))))))))).))))))))....... -47.30 ......(((((((((((.((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).)))).))))).))).)))........ -42.40 ..((((..(((((((((.((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).)))).))))).))))))))....... -46.50 ..(((((..(((((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((.......)).)))))).)))..))))))))).)))))))))).))))))))....... -50.60 # aligned and folded structure ..... ** * ****.***** ************************************* ca.....agatgttgcc.cattggcaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggac tg.....agacgatgcc.cattgacaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggac tg.....ggatgatgcc.cattggcaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggac tg.....agatgttgcc.cattggcaTAAACCCGTAGATCCGATCTTGtggtgaagtggac | |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| || 3 4443 3444 4444424444 444444444 444 444444 43 | |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| || aaaacaatcta..ctggtgtgactgtgtctgggtatcttcgctcgaacac.gg........ gagacagtcta..atggtgtgacggtgtctgggtatctttgctcgaacac.gc........ gaaacagtcta..gtggtgtgacggtgtctgggtatctttgctcgaacgc.gc........ aaaacagtcta..atggtgtgactgtgtctgggtatcttcgctcgaacac.gc........ * *** ****.. ********* *************** ******** *.* ........ >PREDICTED_MIR36 chr6 72169957 72170061 - 14.912 hsa-mir-30a ttgctgttgacagtgagcgaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgctgtgaagccacagatgggctttcagtcggatgtttgcagctgcctactgcctcggacttca tcaacgttgacagtgagcgaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgctgtgaagccacaaatgggctttcagtcggatgtttgcagctgcctactgcctccaacttca tcaatgttgacagtgagcaaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgctgtgaagccacaaatgggctttcagtcggatgtttgcagctgcctactgtctccaacttca tccctcttgacagtgagcgaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgctgtgaagccacagatgggctttcagtcggatgtttgcagctgcctactgcctcagacttca * ************ ************************************* ************************************ *** ****** ...(((....(((((.(((.((((((((((((..((((((((((((((....))).....))))))))))))))))))))))).))).)))))...)))...... -46.40 .....((((.(((((.(((.((((((((((((..((((((((((((((....))).....))))))))))))))))))))))).))).)))))....)))).... -47.00 ....((..(((((((.(((.((((((((((((..((((((((((((((....))).....))))))))))))))))))))))).))).)))))))..))...... -51.50 ......(((((((((.(((.((((((((((((..((((((((((((((....))).....))))))))))))))))))))))).))).)))))..))))...... -45.80 # aligned and folded structure * ... ************ **************************.....******* ttg...ctgttgacagtgagcgaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgct.....gtgaagc tca...acgttgacagtgagcgaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgct.....gtgaagc tca...atgttgacagtgagcaaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgct.....gtgaagc tcc...ctcttgacagtgagcgaCTGTAAACATCCTCGACTGGAAgct.....gtgaagc | | ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| 4 3 223 4144444 444 444444444444 44444444444 444 | | ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| acttcagact.ccgtcatccgtcgacgtttgtagg..ctgactttcgggtagacac.... acttcaacct.ctgtcatccgtcgacgtttgtagg..ctgactttcgggtaaacac.... acttcaacct.ccgtcatccgtcgacgtttgtagg..ctgactttcgggtaaacac.... acttcaggct.ccgtcatccgtcgacgtttgtagg..ctgactttcgggtagacac.... ****** **.* **********************..************** ****.... >PREDICTED_MIR37 chr9 108888043 108888147 - 14.839 hsa-mir-32 ctgcttgctctggtggagatATTGCACATTACTAAGTTGCATgttgtcacggcctcaatgcaatttagtgtgtgtgatattttcacatgagtgcatgcacacggg ctgcttgctctggtggagatATTGCACATTACTAAGTTGCATgttgtcacggcctcaatgcaatttagtgtgtgtgatattttcacatgagtgcatgcacacggg ccgcttgctctggtggggatATTGCACATTACTAAGTTGCATgttgtcacggcctcaatgcaatttagtgtgtgtgatattctcacatgagtgcatgcacacag- ctgcttgctctggtggagatATTGCACATTACTAAGTTGCATgttgtcacggcctcaatgcaatttagtgtgtgtgatatttccacatgagtgcatgcacacggg * ************** **************************************************************** ******************* * .(((.(((.((.((((((((((..(((((.(((((((((((((..((....))..)).))))))))))))))))..))))))))))...)).))).)))...... -46.30 .(((.(((.((.((((((((((..(((((.(((((((((((((..((....))..)).))))))))))))))))..))))))))))...)).))).)))...... -46.30 ..((.(((.((.((((((((((..(((((.(((((((((((((..((....))..)).))))))))))))))))..))))))))))...)).))).))......- -47.80 .(((.(((.((.((((((((((..(((((.(((((((((((((..((....))..)).))))))))))))))))..))))))))))...)).))).)))...... -49.20 # aligned and folded structure *..... **********..**** ************************.********** c.....tgcttgctctg..gtggagatATTGCACATTACTAAGTTGCA.Tgttgtcacg c.....tgcttgctctg..gtggagatATTGCACATTACTAAGTTGCA.Tgttgtcacg c.....cgcttgctctg..gtggggatATTGCACATTACTAAGTTGCA.Tgttgtcacg c.....tgcttgctctg..gtggagatATTGCACATTACTAAGTTGCA.Tgttgtcacg | ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || 3 344 444 44 44444444444444444 44444444444 44 44 | ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || gggcacacgtacgtgagtacacctttatagtgtgtg.tgatttaacgtaactccg.... -gacacacgtacgtgagtacactcttatagtgtgtg.tgatttaacgtaactccg.... gggcacacgtacgtgagtacacttttatagtgtgtg.tgatttaacgtaactccg.... gggcacacgtacgtgagtacacttttatagtgtgtg.tgatttaacgtaactccg.... * ******************* ************.******************.... >PREDICTED_MIR38 chr19 56887834 56887944 + 14.690 hsa-let-7e gtccacctgccgcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGaggaggacacccaaggagatcactatacggcctcctagctttccccaggctgcgccctgcacgg gcccacctgccgcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGaggaagacacccgaggagatcactatacggcctcctagctttccccaggctgcgccctgcactg gcccacctgccgcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGaggaagacacccgaggagatcactatacggcctcctagctttccccaggctgcgccctgcactg gtccacctgccgcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGaggaggacacccacggagatcactatacggcctcctagctttccccaggctgcgccctgcacgg * ************************************************* ******* ************************************************ * .....(((((.((((..((.(((..(((.((((((((((((((((.((...((....)).......)))))))))))))))))).)))..))).))..))))...))).)) -50.70 .......(((.((((..((.(((..(((.((((((((((((((((.((......(......)....)))))))))))))))))).)))..))).))..))))...)))... -47.70 .......(((.((((..((.(((..(((.((((((((((((((((.((......(......)....)))))))))))))))))).)))..))).))..))))...)))... -47.70 .....(((((.((((..((.(((..(((.((((((((((((((((.((.(.((....)).).....)))))))))))))))))).)))..))).))..))))...))).)) -50.80 # aligned and folded structure * *****.****..**************************************....** ***** gtccacc.tgcc..gcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGag....gaggacac gcccacc.tgcc..gcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGag....gaagacac gcccacc.tgcc..gcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGag....gaagacac gtccacc.tgcc..gcgccccccgggctGAGGTAGGAGGTTGTATAGTTGag....gaggacac || ||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||| || | || 42 444 4444 44 444 444 4444444444444444 44 1 24 || ||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||| || | || .....ggcacgtcccgcgtcggacccctttcgatcctccggcatatca.ctagaggcacc.... .....gtcacgtcccgcgtcggacccctttcgatcctccggcatatca.ctagaggagcc.... .....gtcacgtcccgcgtcggacccctttcgatcctccggcatatca.ctagaggagcc.... .....ggcacgtcccgcgtcggacccctttcgatcctccggcatatca.ctagaggaacc.... .....* *****************************************.******* **.... >PREDICTED_MIR39 chr19 13846506 13846616 + 14.591 hsa-mir-181c caggtcccggaaaatttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcaggcaaaccatcgaccgttgagtggaccctgaggcctggaattgc cagttatccaagaacttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcagacaaaccatcgaccgttgagtggaccccgaggcctggaactgc cagttatccaagaacttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcagacaaaccatcgaccgttgagtggaccccgaggcctggaactgc tggcccctggagaagttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcaggcaaaccatcgaccgttgagtggaccccgaggcctggaactgc * * ** ***************************************************** ************************** *********** *** (((.(((...............((((((.((((..((((((((..(((((((.(((((...........)))))))))))).))))))))..)))).))))))))).))). -41.76 (((((.................((((((.((((..((((((((..(((((((.(((((...........)))))))))))).))))))))..)))).))))))..))))). -45.61 (((((.................((((((.((((..((((((((..(((((((.(((((...........)))))))))))).))))))))..)))).))))))..))))). -45.61 ......................((((((.((((..((((((((..(((((((.(((((...........)))))))))))).))))))))..)))).))))))........ -42.80 # aligned and folded structure . * * ** ***************************************************** .caggtcccggaaaatttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcagg .cagttatccaagaacttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcaga .cagttatccaagaacttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcaga .tggcccctggagaagttgccaagggtttgggggaACATTCAACCTGTCGGTGAGTTtgggcagctcagg ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| 4442324 444444 4444 44444444 4444444 44444 ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| cgtcaagg...............tccggagccccaggtgagttgc.cagctac.caaac........... cgtcaagg...............tccggagccccaggtgagttgc.cagctac.caaac........... cgtcaagg...............tccggagccccaggtgagttgc.cagctac.caaac........... cgttaagg...............tccggagtcccaggtgagttgc.cagctac.caaac........... *** ****...............******* **************.*******.*****........... >PREDICTED_MIR40 chr1 204364172 204364276 - 14.359 hsa-mir-29b-2 ttgagatcctcttcttctggaagctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgtaTCTAGCACCATTTGAAATCAGTgttttaggagtaagaattgca gtgagatcctcttcttctggaagctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgtaTCTAGCACCATTTGAAATCAGTgttttaggagtaagaattgca gtgagatcctcttcttctggaagctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgtaTCTAGCACCATTTGAAATCAGTgttttaggagtaagaattgca gtgagatcctcttcttctggaagctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgtaTCTAGCACCATTTGAAATCAGTgttttaggagtaagaattgca ******************************************************************************************************** .........(((((((((((((((((((((((.((((((.((.((((..............)))))))))))).)))))))))).))))))))).))))...... -35.64 ((((.....(((((((((((((((((((((((.((((((.((.((((..............)))))))))))).)))))))))).))))))))).)))).)))). -36.14 ((((.....(((((((((((((((((((((((.((((((.((.((((..............)))))))))))).)))))))))).))))))))).)))).)))). -36.14 ((((.....(((((((((((((((((((((((.((((((.((.((((..............)))))))))))).)))))))))).))))))))).)))).)))). -36.14 # aligned and folded structure . ************.*********.*************************************** .ttgagatcctctt.cttctggaa.gctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgt .gtgagatcctctt.cttctggaa.gctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgt .gtgagatcctctt.cttctggaa.gctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgt .gtgagatcctctt.cttctggaa.gctggtttcacatggtggcttagatttttccatctttgt |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||| 3444 4444 444444444 4444444444 444444 44 4444 |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||| acgtta....agaatgaggattttgTGACTAAAGTTTACCAC.GA.TCTa.............. acgtta....agaatgaggattttgTGACTAAAGTTTACCAC.GA.TCTa.............. acgtta....agaatgaggattttgTGACTAAAGTTTACCAC.GA.TCTa.............. acgtta....agaatgaggattttgTGACTAAAGTTTACCAC.GA.TCTa.............. ******....********************************.**.****.............. >PREDICTED_MIR41 chr17 1563932 1564042 - 14.205 hsa-mir-22 cgccctcacctggctgagccgCAGTAGTTCTTCAGTGGCAAGCtttatgtcctgacccagctaaagctgccagttgaagaactgttgccctctgcccctggcttc------gaggag caccctcacctggctgagccgCAGTAGTTCTTCAGTGGCAAGCtttatgtcctgacccagctaaagctgccagttgaagaactgttgccctctgcccctggcttc------gtggag cacgctcacctggctgagccgCAGTAGTTCTTCAGTGGCAAGCtttatgtcctgacccagctaaagctgccagttgaagaactgttgccctctgccactggcttc------gaggag caccctcatctggctgagccgCAGTAGTTCTTCAGTGGCAAGCtttatgtcctgacccagctaaagctgccagttgaagaactgttgccctctgcccctggcttcaaggaggaggag * * **** *************************************************************************************** ******** * **** ...((((.((.(((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))...))....------)))).. -47.00 (((.....((.(((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))...))....------)))... -43.80 ....................((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).................------...... -32.60 ...((((....(((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))...............)))).. -43.91 # aligned and folded structure * * ****......... **..************************.************************ cgccctca.........cct..ggctgagccgCAGTAGTTCTTCAG.TGGCAAGCtttatgtcctgaccca caccctca.........cct..ggctgagccgCAGTAGTTCTTCAG.TGGCAAGCtttatgtcctgaccca cacgctca.........cct..ggctgagccgCAGTAGTTCTTCAG.TGGCAAGCtttatgtcctgaccca caccctca.........tct..ggctgagccgCAGTAGTTCTTCAG.TGGCAAGCtttatgtcctgaccca | |||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || 4 3434 44 444 444 444444444444444 44444 444444 44 | |||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || ga.ggaggaggaacttcggtccccgtctcc.cgttgtcaagaagttgaccgt.cgaaat.cg......... ga.ggag------cttcggtcaccgtctcc.cgttgtcaagaagttgaccgt.cgaaat.cg......... ga.ggtg------cttcggtccccgtctcc.cgttgtcaagaagttgaccgt.cgaaat.cg......... ga.ggag------cttcggtccccgtctcc.cgttgtcaagaagttgaccgt.cgaaat.cg......... **.** * ******** ********.*********************.******.**......... >PREDICTED_MIR42 chr6 52121682 52121792 + 14.186 hsa-mir-133b tcagaagaaagatgccccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcctgagaggtTTGGTCCCCTTCAACCAGCTACagcagggctggcaatgcccagtcct tccaaagggagtggccccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcctgagaggtTTGGTCCCCTTCAACCAGCTACagcagggctggcaaagctcaatatt tcccaagggagcggccccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcctgagaggtTTGGTCCCCTTCAACCAGCTACagcagggctggcaaagcccaatctt tcccaagggagctgccccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcctgagaggtTTGGTCCCCTTCAACCAGCTACagcagggctggcaatacccagtcct ** *** ** *************************************************************************************** * ** * * ............(((((((((((.((((((((..((.((.((((((.((.((((...)))))))))))).)).))..)))))))).)))))))..))))............ -46.50 ........((((.((((((((((.((((((((..((.((.((((((.((.((((...)))))))))))).)).))..)))))))).)))))))..)))...))))...... -51.30 ......(((....((((((((((.((((((((..((.((.((((((.((.((((...)))))))))))).)).))..)))))))).)))))))..)))....)))...... -52.20 ......(((...(((((((((((.((((((((..((.((.((((((.((.((((...)))))))))))).)).))..)))))))).)))))))..))))...)))...... -51.70 # aligned and folded structure ** *** ** .. ***..***************************************** tcagaagaaaga..tgcc..ccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcct tccaaagggagt..ggcc..ccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcct tcccaagggagc..ggcc..ccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcct tcccaagggagc..tgcc..ccctgctctggctggtcaaacggaaccaagtccgtcttcct | |||| |||| ||||||| |||||||| || || |||||| || |||| 2 3142 2444 4444444 44444444 44 44 444444 44 4444 | |||| |||| ||||||| |||||||| || || |||||| || |||| tcctga..cccataacggtcgggacgaCATCGACCAACTTCCCCTGGTTt.gg.agag... ttctaa..cccgaaacggtcgggacgaCATCGACCAACTTCCCCTGGTTt.gg.agag... ttataa..ctcgaaacggtcgggacgaCATCGACCAACTTCCCCTGGTTt.gg.agag... tcctga..cccgtaacggtcgggacgaCATCGACCAACTTCCCCTGGTTt.gg.agag... * * *..* * *************************************.**.****... >PREDICTED_MIR43 chr17 6861957 6862061 - 14.107 cccggtcctgctcccgccccAGCAGCACACTGTGGTTTGTACggcactgtggccacgtccaaaccacactgtggtgttagagcgagggtgggggaggcaccgccg cccagtcctgcccccgccccAGCAGCACACTGTGGTTTGTACggcactgtggccacgtccaaaccacactgtggtgttagagcgagggtatgggaggcaccgatg cccagtcctgctcccgccccAGCAGCACACTGTGGTTTGTACggcactgtggccacgtccaaaccacactgtggtgttagagcgagggtatgggaggcaccgctg cccagtcctgctcccgccccAGCAGCACACTGTGGTTTGTACggtactgtggccacgtccagaccacactgtggtgttagggtgagggtgggggaggcaccgctg *** ******* ******************************** **************** ****************** * ****** *********** * ..(((((((.(((((((((.((((.((((.(((((((((.(((((......)))..)).))))))))).)))).)))).......)))))))))))).))))... -53.60 ((((....(((((.(((...((((.((((.(((((((((.(((((......)))..)).))))))))).)))).))))...))).)))))))))........... -45.80 ..((((..(((((((((((.((((.((((.(((((((((.(((((......)))..)).))))))))).)))).)))).......))))..)))).)))..)))) -44.80 .((..(((..(((.(((((.((((.((((.(((((((((.(((((......)))..)).))))))))).)))).)))).))))).)))..)))..))........ -50.70 # aligned and folded structure **.* **.***** ********......**********************..** ****** cc.cggt.cctgctcccgcccc......AGCAGCACACTGTGGTTTGTAC..ggcactgtg cc.cagt.cctgcccccgcccc......AGCAGCACACTGTGGTTTGTAC..ggcactgtg cc.cagt.cctgctcccgcccc......AGCAGCACACTGTGGTTTGTAC..ggcactgtg cc.cagt.cctgctcccgcccc......AGCAGCACACTGTGGTTTGTAC..ggtactgtg | |||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| 4 4144 444 444224444 4444 4444 444444444 44 444 | |||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| gtcgccacgga.gggggtgggagtgggattgtggtgtcacaccagacctgcaccg...... gtcgccacgga.gggtatgggagcgagattgtggtgtcacaccaaacctgcaccg...... gtagccacgga.gggtatgggagcgagattgtggtgtcacaccaaacctgcaccg...... gccgccacgga.gggggtgggagcgagattgtggtgtcacaccaaacctgcaccg...... * ********.*** ****** * ****************** **********...... >PREDICTED_MIR44 chr11 57165237 57165341 + 14.086 hsa-mir-130a ggcatgcctctgctgctggccagagctcttttcacattgtgctactgtctgcacctgtcactAGCAGTGCAATGTTAAAAGGGCattggccgtgtagtgctaccc ggcatgcctttgctgctggccggagctcttttcacattgtgctactgtcta-acgtgtaccgAGCAGTGCAATGTTAAAAGGGCatcggccttgtagtactaccc ggcatgcctttgctgctggccggagctcttttcacattgtgctactgtctacacgtgtaccgAGCAGTGCAATGTTAAAAGGGCatcggccttgtagtactaccc ggcatgcctctgctgcgggccggagctcttttcacattgtgctactgtctgcacctaccactAGCAGTGCAATGTTAAAAGGGCattggccgcgtagcactaccc ********* ****** **** **************************** ** * * ************************ **** **** ****** ((...((....((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))))).)))))))..)). -44.00 ..........((((((.(((((..((((((((.((((((..((.((.....-..........)).))..)))))).))))))))..)))))..))))))...... -41.26 ..........((((((.(((((..((((((((.((((((..((.((...(((....)))...)).))..)))))).))))))))..)))))..))))))...... -43.80 ..........(((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((..((.......)).))).))..)))))).)))))))).)))))).)))))))...... -44.90 # aligned and folded structure .********* ******. **** **************************** ** * .ggcatgcctctgctgc.tggccagagctcttttcacattgtgctactgtctgcacct .ggcatgcctttgctgc.tggccggagctcttttcacattgtgctactgtcta-acgt .ggcatgcctttgctgc.tggccggagctcttttcacattgtgctactgtctacacgt .ggcatgcctctgctgc.gggccggagctcttttcacattgtgctactgtctgcacct || | || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| 44 4 41 44444 1444444 44444444 4444444444 442 242 || | || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| cccat.ca....cgatgcgccggttaCGGGAAAATTGTAACGTGACGAtcacca.... cccat.ca....tgatgttccggctaCGGGAAAATTGTAACGTGACGAgccatg.... cccat.ca....tgatgttccggctaCGGGAAAATTGTAACGTGACGAgccatg.... cccat.cg....tgatgtgccggttaCGGGAAAATTGTAACGTGACGAtcactg.... *****.* .... **** **** ************************ * .... >PREDICTED_MIR45 chr11 121475664 121475768 - 13.974 hsa-mir-125b-1 cattgttgcgctcctctcagTCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtttaaatccacgggttaggctcttgggagctgcgagtcgtgcttttgcatcctg tcgtgttgcgctcccctcagTCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtttaaatccacgggttaggctcttgggagctgcgggtcgtgcctttgcatcgct ttgtgttgcgctcccctcagTCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtttaaatccacgggttaggctcttgggagctgcgagtcgtgcctttgcatcgct atttgttgcgctcctctcaaTCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtttaaatccacgggttaggctcttgggagctgcgagtcgtgcctttgcatcctg *********** **** ***************************************************************** ******* ******** ...(((.((((..(((.(((..((..(((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).)))..))..))).)))..))))....)))..... -44.50 ..((((.((((..(((.(((..((..(((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).)))..))..))).)))..))))....)))).... -46.90 ..(((.(((((((....(((..((..(((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).)))..))..))).)))).........))).))). -38.60 ...(((.((((..(((.((.((((.((((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).))))))))..)).)))..))))....)))..... -38.70 # aligned and folded structure .. ****...******* **** .********************************* ca..ttgtt...gcgctcctctcag.TCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtt tc..gtgtt...gcgctcccctcag.TCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtt tt..gtgtt...gcgctcccctcag.TCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtt at..ttgtt...gcgctcctctcaa.TCCCTGAGACCCTAACTTGTGAtgtttaccgtt || |||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||| 11 2444 4444 434 443 4 4444444 44444444444 44444 || |||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||| gtcctacgtttccgtgctgagcgtcga.gggttctcggattgggcacc.taaat..... tcgctacgtttccgtgctgagcgtcga.gggttctcggattgggcacc.taaat..... tcgctacgtttccgtgctgggcgtcga.gggttctcggattgggcacc.taaat..... gtcctacgttttcgtgctgagcgtcga.gggttctcggattgggcacc.taaat..... ******** ******* *******.********************.*****..... >PREDICTED_MIR46 chr3 37985887 37985991 + 13.888 hsa-mir-26a-1 ctggcgaaggccgtggcctcGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtgtgcaggtcccaatgggcctattcttggttacttgcacggggacgcgggcctggacgccggc ctggcgaaggccgtggcctcGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtgtgcaggtcccaaggggcctattcttggttacttgcacggggacgcgggcctggacgccggc ctggcgaaggccgtggccttGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtgtgcaggtcccaaggggcctattcttggttacttgcacggggacgcgggcctggacgcctgc ctggcgaaggccgtggcctcGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtgtgcaggtcccaatgggcctattcttggttacttgcacgcggacgcgggcctggacgctggc ******************* ************************************ ************************* ****************** ** ((((((.((((((((.((((((.(((((((((.((((((((((.((.......))...)))))))))).))))))))).)))))).))).)))))...)))))). -58.70 ((((((.((((((((.((((((.(((((((((.((((((((((.((.......))...)))))))))).))))))))).)))))).))).)))))...)))))). -58.70 ..((((.((((((((.((((((.(((((((((.((((((((((.((.......))...)))))))))).))))))))).)))))).))).)))))...))))... -54.00 ((((((.((((((((.((.(((.(((((((((.((((((((((.((.......))...)))))))))).))))))))).))).)).))).)))))...)))))). -52.20 # aligned and folded structure .*******..*****.******* ************************..********* .ctggcga..aggcc.gtggcctcGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtg..tgcaggtcc .ctggcga..aggcc.gtggcctcGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtg..tgcaggtcc .ctggcga..aggcc.gtggccttGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtg..tgcaggtcc .ctggcga..aggcc.gtggcctcGTTCAAGTAATCCAGGATAGGCtg..tgcaggtcc |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| || 434444 44444 444 443444 444444444 4444444444 44 |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| || cggtcgcaggtccgggcgcaggcgcacgttcattggttcttatccgggtaac....... cgtccgcaggtccgggcgcaggggcacgttcattggttcttatccggggaac....... cggccgcaggtccgggcgcaggggcacgttcattggttcttatccggggaac....... cggccgcaggtccgggcgcaggggcacgttcattggttcttatccgggtaac....... ** ****************** ************************* ***....... >PREDICTED_MIR47 chr1 40889114 40889218 - 13.793 hsa-mir-30e acgaccgtg------gcagcctgccgCTGTAAACATCCGACTGAAAGCtcctctgaacaccttacagcttccagtcaaggatgtttacagtagcaaagactgcccagaaag acgactgtg------gcagcctgccgCTGTAAACATCCGACTGAAAGCtcctctcaacaccttacagcttccagtcaaggatgtttacagtagcaaagactgcccagaaaa acgactgtg------gcagcctgccgCTGTAAACATCCGACTGAAAGCtcctctcaacaccttacagcttccagtcaaggatgtttacagtagcaaagactgccctgaaaa acgaccgtgaccgtggcagcctgccgCTGTAAACATCCGACTGAAAGCccctctgagcaccttacagcttccagtcaaggatgtttacagtagcaaagactgcccagaaag ***** *** ********************************* ***** * ************************************************ **** ........(------((((.((((..(((((((((((((((((.(((((................))))).)))))..))))))))))))..))..)).)))))....... -42.49 ....(((.(------((((.((((..(((((((((((((((((.(((((................))))).)))))..))))))))))))..))..)).)))))))).... -46.99 ........(------((((.((((..(((((((((((((((((.(((((................))))).)))))..))))))))))))..))..)).)))))....... -42.49 ..............(((((.((((..(((((((((((((((((.((((.....((((...))))..)))).)))))..))))))))))))..))..)).)))))....... -41.60 # aligned and folded structure ***** *** *******..****************..********** ***** * *** acgaccgtg------gcagcct..gccgCTGTAAACATCC..GACTGAAAGCtcctctgaacac acgactgtg------gcagcct..gccgCTGTAAACATCC..GACTGAAAGCtcctctcaacac acgactgtg------gcagcct..gccgCTGTAAACATCC..GACTGAAAGCtcctctcaacac acgaccgtgaccgtggcagcct..gccgCTGTAAACATCC..GACTGAAAGCccctctgagcac ||| | |||| || || ||||||||||||| ||||| ||||| |||| 414 4 4444 44 44 4444444444444 44444 44443 4241 ||| | |||| || || ||||||||||||| ||||| ||||| |||| gaaagac.c......cgtcagaaacgatgacatttgtaggaactgaccttcgac...attc... aaaagtc.c......cgtcagaaacgatgacatttgtaggaactgaccttcgac...attc... aaaagac.c......cgtcagaaacgatgacatttgtaggaactgaccttcgac...attc... gaaagac.c......cgtcagaaacgatgacatttgtaggaactgaccttcgac...attc... **** *.*......***************************************...****... >PREDICTED_MIR48 chr17 43469519 43469623 - 13.769 hsa-mir-152 gctcggc-ccgctgtcccccccggcccaggttctgtgatacactccgactcgggctctggagcAGTCAGTGCATGACAGAACTTGggcccggaaggaccttctgca gctcgtcgccgctgttccccg-ggcctaggttctgtgatacactccgactcgggctctggagcAGTCAGTGCATGACAGAACTTGggcccggtaggaccttctgca gctcggcgccgctgttccccg-ggcccaggttctgtgatacactccgactcgggctctggagcAGTCAGTGCATGACAGAACTTGggcccggtaggactttctgca gctgggcgccgctgtcccccc-ggcccaggttctgtgatacactccgactcgggctctggagcAGTCAGTGCATGACAGAACTTGggcccggacggaccttctgca *** * * ******* **** **** ***************************************************************** **** ******* .....((-.....((((..((.((((((((((((((.((.((((..((((...(((....))))))))))).)).)))))))))))))).))..)))).....)). -50.00 .......((....((((.(((-((((((((((((((.((.((((..((((...(((....))))))))))).)).)))))))))))))))))..)))).....)). -49.30 ((.............((((((-((((((((((((((.((.((((..((((...(((....))))))))))).)).)))))))))))))))))..)))......)). -48.41 ((.(((.....((((((....-((((((((((((((.((.((((..((((...(((....))))))))))).)).)))))))))))))).)))))).)))...)). -51.30 # aligned and folded structure *** * * ******* **** **** ********************************* gctcggc-ccgctgtcccccccggcccaggttctgtgatacactccgactcgggctctgg gctcgtcgccgctgttccccg-ggcctaggttctgtgatacactccgactcgggctctgg gctcggcgccgctgttccccg-ggcccaggttctgtgatacactccgactcgggctctgg gctgggcgccgctgtcccccc-ggcccaggttctgtgatacactccgactcgggctctgg ||| | |||| || |||||||||||||| || |||| |||| ||| 343 4 4444 42 44444444444444 44 4444 4444 444 ||| | |||| || |||||||||||||| || |||| |||| ||| a....cgtcttc.caggcaggcccggGTTCAAGACAGTACGTGA..CTGA...cga.... a....cgtcttt.caggatggcccggGTTCAAGACAGTACGTGA..CTGA...cga.... a....cgtcttc.caggatggcccggGTTCAAGACAGTACGTGA..CTGA...cga.... a....cgtcttc.caggaaggcccggGTTCAAGACAGTACGTGA..CTGA...cga.... *....****** .**** *************************..****...***.... >PREDICTED_MIR49 chr14 100581996 100582100 + 13.729 hsa-mir-381 gtgctattgtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcggtttattgacatggaaTATACAAGGGCAAGCTCTCTGTgagtatcaaaccttg-----------tcttgg atgctattgtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcggtttattgacatggaaTATACAAGGGCAAGCTCTCTGTgagtatcaaacctta-----------tcttgg atgctattgtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcggtttattgacatgggaTATACAAGGGCAAGCTCTCTGTgagcatcaaacctta-----------tcttgg atgctattgtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcggtttattgacatagaaTATACAAGGGCAAGCTCTCTGTgagtatcaaaccttgtctgggagtcttcttgg ********************************************************* * ************************** ********** ****** ........((((((((((((.((.(((.((((((((.((((((((.(((....)))...)))))))))))))))).))).)).))))))))))))....-----------...... -45.30 ........((((((((((((.((.(((.((((((((.((((((((.(((....)))...)))))))))))))))).))).)).))))))))))))....-----------...... -45.30 ........(((((((.((((.((.(((.((((((((.((((((((.(((....)))...)))))))))))))))).))).)).)))).)))))))....-----------...... -40.20 ........((((((((((((.((.(((.((((((((.((((((((.(((....)))...)))))))))))))))).))).)).))))))))))))..................... -46.40 # aligned and folded structure *******.............**************************************..******* gtgctatt.............gtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcg..gtttatt atgctatt.............gtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcg..gtttatt atgctatt.............gtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcg..gtttatt atgctatt.............gtttggtacttaaagcgaggttgccctttgtatattcg..gtttatt || | |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||| 44 4 444444434444 44 444 44444444 44444444 444 || | |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||| ggttcttctgagggtctgttccaaactatgagTGTCTCTCGAACGGGAA.CATATaagatacag.... ggttct-----------attccaaactacgagTGTCTCTCGAACGGGAA.CATATagggtacag.... ggttct-----------attccaaactatgagTGTCTCTCGAACGGGAA.CATATaaggtacag.... ggttct-----------gttccaaactatgagTGTCTCTCGAACGGGAA.CATATaaggtacag.... ****** ********** ********************.****** * *****.... >PREDICTED_MIR50 chrX 53467164 53467268 - 13.716 hsa-let-7f-2 acactggtgctctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTtagggtcataccccatcttggagataactatacagtctactgtctttcccacggtggtacact acactggtgctctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTtagggtcataccccatcttggagataactatacagtctactgtctttcccacggtggtacact acactggtgctctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTtagggtcataccccatcttggagataactatacagtctactgtctttcccacggtggtacact acactggtgctctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTtagggtcataccccatcttggagataactatacagtctactgtctttcccacggtggtacact ********************************************************************************************************* ......(((((((((((((.(((..((((((((((((((((...(((.....)))............))))))))))))))))..))))))))))).)))))... -48.66 ......(((((((((((((.(((..((((((((((((((((...(((.....)))............))))))))))))))))..))))))))))).)))))... -48.66 ......(((((((((((((.(((..((((((((((((((((...(((.....)))............))))))))))))))))..))))))))))).)))))... -48.66 ......(((((((((((((.(((..((((((((((((((((...(((.....)))............))))))))))))))))..))))))))))).)))))... -48.66 # aligned and folded structure ***********.*********************************.........******** acactggtgct.ctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTta.........gggtcata acactggtgct.ctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTta.........gggtcata acactggtgct.ctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTta.........gggtcata acactggtgct.ctgtgggatGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTta.........gggtcata | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| 4 44444 44444444 444444444444444444444 4 444 | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| tca...catggtggcaccct.ttctgtcatctgacatatcaatagaggttctacccc..... tca...catggtggcaccct.ttctgtcatctgacatatcaatagaggttctacccc..... tca...catggtggcaccct.ttctgtcatctgacatatcaatagaggttctacccc..... tca...catggtggcaccct.ttctgtcatctgacatatcaatagaggttctacccc..... ***...**************.************************************..... >PREDICTED_MIR51 chr8 65454257 65454361 + 13.659 hsa-mir-124a-2 cggatcaagattagaggctctgctctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatacaATTAAGGCACGCGGTGAATGCCaagagcggagcctacggctgc tagatcaagatcagagactctgctctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatacaATTAAGGCACGCGGTGAATGCCaagagcggagcctacggctgc tagatcaagatcagagactctgctctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatacaATTAAGGCACGCGGTGAATGCCaagagcggagcctacggctgc cggatcaagatcaga--ctctgccctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatacaATTAAGGCACGCGGTGAATGCCaagagcggagcctatggctgc ********* *** ****** ************************************************************************** ****** .......((.....((((((((((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..))))))))))))....)).. -47.70 ..............((.(((((((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..))))))))).))........ -40.00 ..............((.(((((((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..))))))))).))........ -40.00 (((.(((.....((.--((((((.((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)).)))))).)).)))))). -35.40 # aligned and folded structure . ********* *** ****** ************************************* .cggatcaagattagaggctctgctctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatac .tagatcaagatcagagactctgctctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatac .tagatcaagatcagagactctgctctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatac .cggatcaagatcaga--ctctgccctccgtgttcacagcggaccttgatttaatgtcatac | || | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| 4 44 4 431444444344 44444444 444 44444444 | || | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| cg......tcggta.tccgaggcgagaaCCGTAAGTGGCGCACGGAATTAa........... cg......tcggca.tccgaggcgagaaCCGTAAGTGGCGCACGGAATTAa........... cg......tcggca.tccgaggcgagaaCCGTAAGTGGCGCACGGAATTAa........... cg......tcggca.tccgaggcgagaaCCGTAAGTGGCGCACGGAATTAa........... **......**** *.************************************........... >PREDICTED_MIR52 chr14 100405145 100405249 + 13.565 tcattctggcctccagggctTTGTACATGGTAGGCTTTCATTcattcgtttgcacattcggtgaaggt-ctactgtgtgccaggccctgtgccaggcatcgtgtag tcactctggccgccagggccTTGTACATGGTAGGCTTTCATTcattt-tttgcacattcggtgaaggtcctactgtgtgccaggccctgtgccaggcatcgtgtag tcattctggcctccagggccTTGTACATGGTAGGCTTTCATTcattg-tttgcacattcggtgaaggt-ctactgtgtgccaggccctgtgccaggcatcgtgtag cccctctggccgccagggccTTGTACATGGTAGGCTTTCATTcattcgtttgcacattcggtgaaggt-ctactgtgtgccaggccctgtgccaggcatcgagtaa * ******* ******* ************************** ******************** ******************************** *** ....((((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))-))))))))))).)))))))).)))))).......... -49.40 .(((((((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....-...........)))))))).)))))))))))).)))))))).))))))....)))... -51.69 ....((((((...((((((((.((((((((((((((((((((...((-(....)))...)))))))))-))))))))))).)))))))).)))))).......... -55.10 ...(((..(((((((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))-))))))))))).)))))))).))..)))...)))... -53.20 # aligned and folded structure ..* ....******* ******* *************.************* ***** t..cat....tctggcctccagggctTTGTACATGGTAG.GCTTTCATTcattcgtttgc t..cac....tctggccgccagggccTTGTACATGGTAG.GCTTTCATTcattt-tttgc t..cat....tctggcctccagggccTTGTACATGGTAG.GCTTTCATTcattg-tttgc c..ccc....tctggccgccagggccTTGTACATGGTAG.GCTTTCATTcattcgtttgc | ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | | || 3 434 444444 44444444 44444444444 444444444 4 4 24 | ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | | || aatgagctacggaccgt..gtcccggaccgtgtgtcatc-tggaagtggctta.ca.... gatgtgctacggaccgt..gtcccggaccgtgtgtcatc-tggaagtggctta.ca.... gatgtgctacggaccgt..gtcccggaccgtgtgtcatcctggaagtggctta.ca.... gatgtgctacggaccgt..gtcccggaccgtgtgtcatc-tggaagtggctta.ca.... *** ************..******************** *************.**.... >PREDICTED_MIR53 chr8 135881940 135882048 - 13.560 hsa-mir-30b tt---aagtcctgctttaaaccaagtttcagttcatGTAAACATCCTACACTCAGCTGtaatacatggattggctgggaggtggatgtttacttcagctgacttggaatgtc tct-caagtctctctctaagccaagtttcagttcatGTAAACATCCTACACTCAGCTGtcatacatgcgttggctgggatgtggatgtttacgtcagctgtcttggagtatc tca-caggtccctctttaagccgagtttcagttcatGTAAACATCCTACACTCAGCTGtcatacatgagttggctgggatgtggatgtttacgtcagctgtcttggagtatc tttgtaagtcctgattgaagccaagttgcagttcatGTAAACATCCTACACTCAGCTGtagtacatggattggctgggaggtggatgtttacttcagctgacttggaatatc * * *** * ** ** **** ******************************* ****** ********** ************ ******* ****** * ** ..---...............(((((..((((((...((((((((((.((.((((((((............))))))))..))))))))))))...)))))))))))...... -37.60 ...-............((..(((((...(((((.((((((((((((.(((((((((((.(........).)))))))).))))))))))))))).))))).)))))..)).. -42.70 ...-............((..(((((...(((((.((((((((((((.((((((((((((((....)))..)))))))).))))))))))))))).))))).)))))..)).. -43.10 ....................((((((..(((((...((((((((((.((.((((((((............))))))))..))))))))))))...)))))))))))...... -37.10 # aligned and folded structure * * *** * ** ** **** **********************.********* .. **** tt---aagtcctgctttaaaccaagtttcagttcatGTAAACATCCTACA.CTCAGCTGta..ataca tct-caagtctctctctaagccaagtttcagttcatGTAAACATCCTACA.CTCAGCTGtc..ataca tca-caggtccctctttaagccgagtttcagttcatGTAAACATCCTACA.CTCAGCTGtc..ataca tttgtaagtcctgattgaagccaagttgcagttcatGTAAACATCCTACA.CTCAGCTGta..gtaca || ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | | 34 44444 144444 424444444444 442 44444444 2 4 || ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | | ct..............ataaggttc..agtcgacttcatttgtagg.tggagggtcggttaggt.... ct..............atgaggttc..tgtcgactgcatttgtagg.tgtagggtcggttgagt.... ct..............atgaggttc..tgtcgactgcatttgtagg.tgtagggtcggttgcgt.... ct..............gtaaggttc..agtcgacttcatttgtagg.tggagggtcggttaggt.... **.............. * ******.. ******* **********.** ********** **.... >PREDICTED_MIR54 chr5 54502097 54502207 - 13.524 NEW_AND_VALIDATED ctgtgtgtgatgagcTGGCAGTGTATTGTTAGCTGGTtgaatatgtgaatggcatcggctaacatgcaactgctgtcttattgcatatacaatgaacatcagagtgtaact ctgtgtgtgatggctTGGCAGTGTATTGTTAGCTGGTtgagtatgtgagcggcaccagctaacatgcgactgctctcctattgcacacacaatcaccaccagcatgca--- ctgtgtgcgatgggtTGGCAGTGTATTGTTAGCTGGTtgagtatgtaaaaggcaccagctaacatgcaactgctctcctattgcacatacaatcaacagcaggatgcaagt ccgtgtgtgatgggtTGGCAGTGTATTGTTAGCTGGTtgaatatatgaatggcatcagctaacatgcaactgctatcttattgcatatacaatgaacatcagtgtataat- * ***** **** ************************* *** * * **** * ********** ****** ** ******* * ***** * ** *** * * .((((((..(((((.(((((((((((.((((((((((....(((....)))..)))))))))))))).))))))).)))))..))))))...................... -39.00 .((((((..((((...((((((((((.((((((((((...((......))...)))))))))))))).))))))...))))..))))))...................--- -44.90 .(((((((((((((..((((((((((.((((((((((................)))))))))))))).))))))..)))))))))))))...................... -47.49 ..(((((..(((((.(((((((((((.((((((((((...((......))...)))))))))))))).))))))).)))))..)))))......................- -39.00 # aligned and folded structure *..................... ***** **** *******.****************** *** * * c.....................tgtgtgtgatgagcTGGCAGT.GTATTGTTAGCTGGTtgaatatgtga c.....................tgtgtgtgatggctTGGCAGT.GTATTGTTAGCTGGTtgagtatgtga c.....................tgtgtgcgatgggtTGGCAGT.GTATTGTTAGCTGGTtgagtatgtaa c.....................cgtgtgtgatgggtTGGCAGT.GTATTGTTAGCTGGTtgaatatatga ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| 3444444444443 2444444 4444 4444444444 424 ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| -taatatgtgactacaagtaacatatacgttattctatcgtcaacgta.caatcgactacg..gta.... tgaacgtaggacgacaactaacatacacgttatcctctcgtcaacgta.caatcgaccacg..gaa.... ---acgtacgaccaccactaacacacacgttatcctctcgtcagcgta.caatcgaccacg..gcg.... tcaatgtgagactacaagtaacatatacgttattctgtcgtcaacgta.caatcggctacg..gta.... * * *** ** * ***** * ******* ** ****** ****.****** * ***..* .... >PREDICTED_MIR55 chr17 1900314 1900418 - 13.431 hsa-mir-212 accccgcccggacagcgcgccggcaccttggctctagactgcttactgcccgggccgccctcAGTAACAGTCTCCAGTCACGGCcaccgacgcctggccccgccc tccccgcccgggcagcgcgccggcaccttggctctagactgcttactgcccgggccgccttcAGTAACAGTCTCCAGTCACGGCcaccgacgcctggccccgccc tccccgcccgggcagcgcgccggcaccttggctctagactgcttactgcccgggccgccctcAGTAACAGTCTCCAGTCACGGCcaccgacgcctggccccgccc cccccgcccgggcagcgcgccggcaccttggctctagactgcttactgcccgggccgccctcAGTAACAGTCTCCAGTCACGGCcaccgacgcctggctccgccc ********** *********************************************** ************************************** ****** .....((..((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).))..)).. -42.20 .....((..((((((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...((....))..))))))))))))..))))).))...))).))))).)))).)).. -43.30 .....((..((((((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).))))).)))).)).. -44.70 .....((..((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).))..)).. -43.00 # aligned and folded structure ********** *************.******************************** accccgcccggacagcgcgccggca.ccttggctctagactgcttactgcccgggccg tccccgcccgggcagcgcgccggca.ccttggctctagactgcttactgcccgggccg tccccgcccgggcagcgcgccggca.ccttggctctagactgcttactgcccgggccg cccccgcccgggcagcgcgccggca.ccttggctctagactgcttactgcccgggccg || || ||| ||| ||| || ||||| |||||| |||||| ||| 44 44 444 444 444 44 44444 444444 444444 444 || || ||| ||| ||| || ||||| |||||| |||||| ||| cc...cgcctcggtc.cgcagccacCGGCACTGACCTCTGAC.AATGAct..ccc... cc...cgccccggtc.cgcagccacCGGCACTGACCTCTGAC.AATGAct..ccc... cc...cgccccggtc.cgcagccacCGGCACTGACCTCTGAC.AATGAct..tcc... cc...cgccccggtc.cgcagccacCGGCACTGACCTCTGAC.AATGAct..ccc... **...**** *****.**************************.*******.. **... >PREDICTED_MIR56 chr2 56139489 56139593 + 13.274 atgcttgaagatgtcagactgtagaatctctacgggtaagtgtgtgatttcctcagtgacatCACATTTGCCTGCAGAGATTTTccagtctgccac-tttgaagtt atgcttgatgttgtcagactgaagaatctctacaggtaagtgtgtggtttcttcagtgacatCACATTTGCCTGCAGAGATTTCccagtctgccaa-tgtgcaatt atgcttgatgttgtcagactgaagaatctctacaagtaagtgtgtgatttcttcagtgacatCACATTTGCCTGCAGAGATTTCccagtctgccaa-cgtgcaatt atgcttgaagatgtcagactgcagaatctctacgggtaagtgtgtgatttctttagtgacatCACATTTGCCTGCAGAGATTTTccagtctgtcacttttgaagtt ******** * ********** *********** *********** **** * ***************************** ******** ** ** * ** ..((((.(((.((.(((((((.(((((((((.((((((((((((((.((........)))).)))))))))))).))))))))).))))))).)).-))).)))). -45.90 .(((...((((((.(((((((..((((((((.((((((((((((..(((........)))..)))))))))))).))))))))..))))))).)))-))))))... -48.40 .(((...((((((.(((((((..((((((((.((.((((..(((((((.((......)).))))))))))).)).))))))))..))))))).)))-))))))... -43.00 ..((((.((((((.(((((((.(((((((((.(((((((..(((((((.((......)).)))))))))))))).))))))))).))))))).)).)))).)))). -48.30 # aligned and folded structure ******** *. ********** *********** *********.** **** * *** atgcttgaag.atgtcagactgtagaatctctacgggtaagtgtg.tgatttcctcagt atgcttgatg.ttgtcagactgaagaatctctacaggtaagtgtg.tggtttcttcagt atgcttgatg.ttgtcagactgaagaatctctacaagtaagtgtg.tgatttcttcagt atgcttgaag.atgtcagactgcagaatctctacgggtaagtgtg.tgatttctttagt | |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || || 4 4242 444 244 4444444 244444444 443444444444 44 44 | |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || || t.tgaagttttcactgtctgaccTTTTAGAGACGTCCGTTTACACtac.ag........ t.taacgtgc-aaccgtctgaccCTTTAGAGACGTCCGTTTACACtac.ag........ t.taacgtgt-aaccgtctgaccCTTTAGAGACGTCCGTTTACACtac.ag........ t.tgaagttt-caccgtctgaccTTTTAGAGACGTCCGTTTACACtac.ag........ *.* * ** ** ******** ************************.**........ >PREDICTED_MIR57 chr12 6943515 6943619 + 13.170 hsa-mir-141 c----tctgtcggccggccctgggtccatcttccagtacagtgttggatggtctaattgtgaagctCCTAACACTGTCTGGTAAAGATggctcccgggtgggttctctc caatttatattggctggctctgggtccatcttccagtgcagtgttggatggttgaagtatgaagctCCTAACACTGTCTGGTAAAGATggcccccgggtcagttccttc caatttatgttggctgactctgagtccatcttccagtgcagtgttggatggttgaagtacgaagctCCTAACACTGTCTGGTAAAGATggcccccgggtcagttccctc g----cacgtccgccggctctgggtccatcttccagtacagtgttggatggtctagtcacgaagctCCTAACACTGTCTGGTAAAGATggcccccgggccggttccctc * ** * * *** ************** ************** * ******************************* ****** **** ** .----......((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))..))))))).))))..... -48.90 ...........(((((((((.(((.(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..))))))).))).)))))))))..... -48.60 ...........(((((((((.....(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..))))))).....)))))))))..... -40.90 .----.......((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).))).))))))))...... -52.30 # aligned and folded structure * ** * * *** **.*******..***** *******.******..* * c----tctgtcggccggccctgggt.ccatctt..ccagtacagtgtt.ggatgg..tctaattgt caatttatattggctggctctgggt.ccatctt..ccagtgcagtgtt.ggatgg..ttgaagtat caatttatgttggctgactctgagt.ccatctt..ccagtgcagtgtt.ggatgg..ttgaagtac g----cacgtccgccggctctgggt.ccatctt..ccagtacagtgtt.ggatgg..tctagtcac ||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||| | || 121 344434444 434 4444444 4444 44444444 444 4 44 ||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||| | || ctccc......ttggccggg.cccccggTAGAAATGGTC.TGTCACAATCCt..cgaag....... ctccc......ttgactggg.cccccggTAGAAATGGTC.TGTCACAATCCt..cgaag....... cttcc......ttgactggg.cccccggTAGAAATGGTC.TGTCACAATCCt..cgaag....... ctctc......ttgggtggg.ccctcggTAGAAATGGTC.TGTCACAATCCt..cgaag....... ** *......*** ***.*** **************.************..*****....... >PREDICTED_MIR58 chr21 16834009 16834113 + 13.159 hsa-let-7c gaagctgtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctgggagtTAACTGTACAACCTTCTAGCTTtccttggagcacacttgagcc gaagctgtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctgggagtTAACTGTACAACCTTCTAGCTTtccttggagcacacttgagcc gaagctgtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctgggagtTAACTGTACAACCTTCTAGCTTtccttggagcacacttgagcc gaagctgtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctgggagtTAACTGTACAACCTTCTAGCTTtccttggagcacacttgagcc ********************************************************************************************************* ...(((((((((.((((((..(((.(((.(((((((((((((.......((.((...)).)).))))))))))))).))).)))..))))))))))))...))). -44.00 ...(((((((((.((((((..(((.(((.(((((((((((((.......((.((...)).)).))))))))))))).))).)))..))))))))))))...))). -44.00 ...(((((((((.((((((..(((.(((.(((((((((((((.......((.((...)).)).))))))))))))).))).)))..))))))))))))...))). -44.00 ...(((((((((.((((((..(((.(((.(((((((((((((.......((.((...)).)).))))))))))))).))).)))..))))))))))))...))). -44.00 # aligned and folded structure ******...*************************************************** gaagct...gtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctg gaagct...gtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctg gaagct...gtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctg gaagct...gtgtgcatccgggttgaggtagtaggttgtatggtttagagttacaccctg | ||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| || || 4 444 444444 444444 444 444 4444444444444 44 44 | ||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| || || c..cgagttcacacg.aggttcctTTCGATCTTCCAACATGTCAAT......tgagg... c..cgagttcacacg.aggttcctTTCGATCTTCCAACATGTCAAT......tgagg... c..cgagttcacacg.aggttcctTTCGATCTTCCAACATGTCAAT......tgagg... c..cgagttcacacg.aggttcctTTCGATCTTCCAACATGTCAAT......tgagg... *..************.******************************......*****... >PREDICTED_MIR59 chr19 56888312 56888416 + 13.102 hsa-mir-125a accatgttgccagtctctagGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtgaggacatccagggtcacaggtgaggttcttgggagcctggcgtctggcccaaccacacacc gctacactgccggcctctggGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtgaggacgtccagggtcacaggtgaggttcttgggagcctggcgcctggcccagccacaaatt gctgcattgccggcctctggGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtgaggacgtccagggtcacaggtgaggttcttgggagcctggcgcctggctcagccaca-act accacactgccggcctctggGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtgaggacatccagggtcacaggtgaggttcttgggagcctggcgtctggcgtaaccacaagcc * **** * **** ****************************** ************************************ ***** * ***** ........(((((...(((((..((..(((.((((..((((((((((....))....)))))))))))).)))..))..)))))...)))))............. -46.10 (((.....((((((..(((((..((..(((.((((..((((((((((....))....)))))))))))).)))..))..))))).))).)))..)))........ -46.10 ((((....((((((..(((((..((..(((.((((..((((((((((....))....)))))))))))).)))..))..))))).))).))).))))....-... -50.00 ........(((((...(((((..((..(((.((((..((((((((((....))....)))))))))))).)))..))..)))))...)))))............. -44.30 # aligned and folded structure ........ * **** *. **** **************************....**** * ........accatgttgccag.tctctagGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtga....ggacat ........gctacactgccgg.cctctggGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtga....ggacgt ........gctgcattgccgg.cctctggGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtga....ggacgt ........accacactgccgg.cctctggGTCCCTGAGACCCTTTAACCTGtga....ggacat ||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||| || 22221 44444 4 444444 4444444 4444 44444444 44 ||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||| || ccgaacaccaatg...cggtctgc.ggtccgagggttcttggag..tggacactgggacc.... tca-acaccgact...cggtccgc.ggtccgagggttcttggag..tggacactgggacc.... ttaaacaccgacc...cggtccgc.ggtccgagggttcttggag..tggacactgggacc.... ccacacaccaacc...cggtctgc.ggtccgagggttcttggag..tggacactgggacc.... ***** * ...***** **.*******************..**************.... >PREDICTED_MIR60 chr7 156866492 156866602 - 12.906 hsa-mir-153-2 tgccagctaattagcggtggccagtgtcatttttgtgatgttgcagctagtaatatgagcccagTTGCATAGTCACAAAAGTGATCattggaaactgtgactgtactgcag tgccagctacttagcggtggccggtgtcatttttgtgacgttgcagctagtaatatgagcccagTTGCATAGTCACAAAAGTGATCattggaaactgtgactgca--gcag tgccagctacttagcggtggccagtgtcatttttgtgatgttgcagctagtaatatgagcccagTTGCATAGTCACAAAAGTGATCattggaaactgtgactgca--gcag tgccagctaatgagcggtggccagtgtcatttttgtgatgttgcagctagtaatatgagcccagTTGCATAGTCACAAAAGTGATCattggaggctgtgactctgctgcag ********* * ********** *************** ***************************************************** ******** **** (((.((.((....(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..))))).....))))))). -44.60 .....(((.(...(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..)))))....).)--)).. -46.10 .....(((.(...(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..)))))....).)--)).. -45.50 (((.(((......(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..)))))......)))))). -48.70 # aligned and folded structure .********* * *.********* ***.************ **********.********* .tgccagctaatta.gcggtggccagtg.tcatttttgtgatgttgcagcta.gtaatatga .tgccagctactta.gcggtggccggtg.tcatttttgtgacgttgcagcta.gtaatatga .tgccagctactta.gcggtggccagtg.tcatttttgtgatgttgcagcta.gtaatatga .tgccagctaatga.gcggtggccagtg.tcatttttgtgatgttgcagcta.gtaatatga ||| || ||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || 444 22 422 1 44444 444444 4444444444444 4444444 44 ||| || ||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || gacg.tc.gtctcagtgtcggaggttaCTAGTGAAAACACTGATACGTTgacccg....... gacg.--.acgtcagtgtcaaaggttaCTAGTGAAAACACTGATACGTTgacccg....... gacg.--.acgtcagtgtcaaaggttaCTAGTGAAAACACTGATACGTTgacccg....... gacg.tc.atgtcagtgtcaaaggttaCTAGTGAAAACACTGATACGTTgacccg....... ****. . ******** **********************************....... >PREDICTED_MIR61 chr14 100565711 100565815 + 12.757 agtgctaatcttcgatactcgaaggagaggttgtccgtgttgtcttctctttatttatgatgAAACATACACGGGAAACCTCTTttttagtatcaaatcccaccc agtgctaa---ttgatacttgaaggagaggttgtccgtgttgtcttctctttatttatgatgAAACATACACGGGAAACCTCTTttttagtatcaaatcccaccc agtgctaa---ttgatacttgaaggagaggttgtccgtgttgtcttctctttatttatgatgAAACATACACGGGAAACCTCTTttttagtatcaaatcccacct agtgctaatcgtcgatactcgaaggagaggttgtccgtgttgtcttctctttatttatgatgAAACATACACGGGAAACCTCTTttttagtatcaaatcccaccc ******** * ****** ************************************************************************************ .............((((((.((((((((((((..(((((((((.(((((.........)).)))))).))))))..))))))))))))))))))........... -36.10 .(((....---((((((((.((((((((((((..(((((((((.(((((.........)).)))))).))))))..))))))))))))))))))))....))).. -39.40 .(((....---((((((((.((((((((((((..(((((((((.(((((.........)).)))))).))))))..))))))))))))))))))))....))).. -39.40 .............((((((.((((((((((((..(((((((((.(((((.........)).)))))).))))))..))))))))))))))))))........... -36.10 # aligned and folded structure *.******* * ****** ********************.*******.*********** a.gtgctaatcttcgatactcgaaggagaggttgtccgtgt.tgtcttc.tctttatttat a.gtgctaa---ttgatacttgaaggagaggttgtccgtgt.tgtcttc.tctttatttat a.gtgctaa---ttgatacttgaaggagaggttgtccgtgt.tgtcttc.tctttatttat a.gtgctaatcgtcgatactcgaaggagaggttgtccgtgt.tgtcttc.tctttatttat | ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| || 1 444 4 42444444 444444444444 4444444 444 444 44 | ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| || cccacccta...aactatga.ttttTTCTCCAAAGGGCACATACA.AAgtag......... tccacccta...aactatga.ttttTTCTCCAAAGGGCACATACA.AAgtag......... cccacccta...aactatga.ttttTTCTCCAAAGGGCACATACA.AAgtag......... cccacccta...aactatga.ttttTTCTCCAAAGGGCACATACA.AAgtag......... ********...********.************************.******......... >PREDICTED_MIR62 chr7 129008464 129008574 - 12.732 hsa-mir-96 ca-gtgccatctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTtgtgtctctccgctctgagcaatcatgtgcagtgccaatatgggaaaagcaggac-ccgcagctgcg ca-gtaccatctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTtgtgtctctccgctgtgagcaatcatgtgtagtgccaatatgggaaaagcgggctgctgcggccacg ca-gtaccatctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTtgtgtctctccgctctgagcaatcatgtgcagtgccaatatgggaaaagcgggctgctgcggccacg cacttcccacctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTtgtgtctctccgctctgagcaatcatgtgcagtgccaatatgggaaaagcggga--ccgcagccgcg ** * *** ************************************************** ************** ******************** ** * ** ** ** ((-((((..(((((((..((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))..)))))))..-..))).))).. -50.30 ((-(((...(((((((..((.((.(((((((((.(((((..(((((..(((......)).)..)))))..)))))))))))))).)).))..))))))).)))))........ -47.00 ((-(((...(((((((..((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))..))))))).)))))........ -48.80 .........(((((((..((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))..))))))).--........... -48.20 # aligned and folded structure ..** .* ***... *************************************...********* ..ca-g.tgcca...tctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTt...gtgtctctc ..ca-g.tacca...tctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTt...gtgtctctc ..ca-g.tacca...tctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTt...gtgtctctc ..cact.tccca...cctgcttggccgattTTGGCACTAGCACATTTTTGCTt...gtgtctctc || | ||| ||||||| || || |||||||| |||||| |||||| ||| 21 3 414 4444444 44 44 44444444 444444 444444 444 || | ||| ||||||| || || |||||||| |||||| |||||| ||| gcgc.cgacgcc--agggcgaaaagggtataaccgtga.cgtgtactaacgagtctcgc...... gcac.cggcgtcgtcgggcgaaaagggtataaccgtga.cgtgtactaacgagtctcgc...... gcac.cggcgtcgtcgggcgaaaagggtataaccgtga.tgtgtactaacgagtgtcgc...... gcgt.cgacgcc-caggacgaaaagggtataaccgtga.cgtgtactaacgagtctcgc...... ** .** ** * ** ********************. ************** ****...... >PREDICTED_MIR63 chr18 17662955 17663059 - 12.575 hsa-mir-1-2 caact----tagtaatacctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgcTATGGAATGTAAAGAAGTATGTatttttggtaggcaataaacc cggccggcgcaggagtgcctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacattcagtgcTATGGAATGTAAAGAAGTATGTattttgggtaggtaatgt-cc cggca----caatagtgcctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacatagaatgcTATGGAATGTAAAGAAGTGTGTattttgggtaggtaatgt-cc caact----tagtaaaacctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgcTATGGAATGTAAAGAAGTATGTatttttggtaggcaataaact * * * * *********** ****************************** * ********************* ******** ****** *** * .....----........((((((.(((((((((((((((((((((..(((((..............))))).))))))))))))))))))))).))))))......... -35.64 .....((.(((....(((((((((((((.((((((((((((((((..(((((...((.....))..))))).)))))))))))))))).))))))))))))).)))-)) -44.60 .((.(----((....(((((((((((((.((((((((((((((((..(((((..............))))).)))))))))))))))).))))))))))))).)))-)) -42.04 .....----........((((((.(((((((((((((((((((((..(((((..............))))).))))))))))))))))))))).))))))......... -35.64 # aligned and folded structure * * * * *********** ****************************** * caact----tagtaatacctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacataca cggccggcgcaggagtgcctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacattca cggca----caatagtgcctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacataga caact----tagtaaaacctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacataca || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || 11 144 324444442444424444444444444444 44444 41 || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || .....tcaaata...acggatggtttttaTGTATGAAGAAATGTAA.GGTATcg.ta..... .....cc-tgta...atggatgggttttaTGTGTGAAGAAATGTAA.GGTATcg.ta..... .....cc-tgta...atggatgggttttaTGTATGAAGAAATGTAA.GGTATcg.tg..... .....ccaaata...acggatggtttttaTGTATGAAGAAATGTAA.GGTATcg.ta..... ..... * **...* ****** ******** *************.*******.* ..... >PREDICTED_MIR64 chrX 113880997 113881107 + 12.556 NEW_AND_VALIDATED gccgggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctatttcata-taagagggggctggctggTTGCATATGTAGGATGTCCCATctcccagcccacttcgtca acgaggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctacttcatactaagagggggctggctggTTGCATATGTAGGATGTCCCATctcctggcccacttcgtca acggggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctacttcatactaagagggggctggctggTTGCATATGTAGGATGTCCCATctcccggcccacttcgtca gcagggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctattttatacta--agggggctggctggTTGCATATGTAGGATGTCCCATctccccgcccacttcatcg * ***************************************** ** *** ** **************************************** ********* ** ((.(((((((.(.((((((((((((.(((.(((((..(..((((...((...-...))))))..)..))))).))))))))))))))).).))))))).))........... -51.60 .(.(((((((.(.((((((((((((.(((.(((((..(..((((.(((......))).))))..)..))))).))))))))))))))).).))))))).)............ -50.70 .(.(((((((.(.((((((((((((.(((.(((((..(..((((.(((......))).))))..)..))))).))))))))))))))).).))))))).)............ -52.30 ((.(((((((.(.((((((((((((.(((.(((((..(..((((...........--.))))..)..))))).))))))))))))))).).))))))).))........... -51.10 # aligned and folded structure ........... * ***************************************** ** *** ** ...........gccgggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctatttcata-taa ...........acgaggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctacttcatactaa ...........acggggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctacttcatactaa ...........gcagggaggttgaacatcctgcatagtgctgccaggaaatccctattttatacta- || ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | ||||| || 24 4444444 4 444444444444 444 44444 4 44444 43 || ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | ||||| || gctacttcacccgcccctcTACCCTGTAGGATGTAT.ACGTTggtcggtcggggg...a-....... actgcttcacccggccctcTACCCTGTAGGATGTAT.ACGTTggtcggtcggggg...ag....... actgcttcacccggtcctcTACCCTGTAGGATGTAT.ACGTTggtcggtcggggg...ag....... actgcttcacccgaccctcTACCCTGTAGGATGTAT.ACGTTggtcggtcggggg...ag....... ** ********* *********************.******************...* ....... >PREDICTED_MIR65 chr17 24212505 24212609 - 12.519 tcacaacctactgactgccagggcacttgggaatggcaaggaaaccgttaccattactgagtTTAGTAATGGTAATGGTTCTCTtgctatacccagaaaacgtgc atcaagcctgctgacagctgtggcacttgggaatggcgaggaaaccgttaccattactgagtTTAGTAATGGTAACGGTTCTCTtgctgctcccacaaactgtgc cca-agcctaccgacagctgtggcatttgggaatggcgaggaaaccgttaccattactgagtTTAGTAATGGTAATGGTTCTCTtgctgctcccacaaactatgc tcc-agcctgctgaccgccaagacacttggggatggcgaggaaaccgttaccattactgagtTTAGTAATGGTAATGGTTCTCTtgctgtacccacaatacgtgc * *** * *** ** * ** ***** ***** ************************************* ************ **** ** *** .(((......................(((((.((((((((..(((((((((((((((((....)))))))))))))))))..)))))))).))))).....))). -41.83 ...........................(((((..((((((..(((((((((((((((((....)))))))))))))))))..))))))..))))).......... -45.70 ...-.......................(((((..((((((..(((((((((((((((((....)))))))))))))))))..))))))..))))).......... -43.90 ...-...................(((((((((((((((((..(((((((((((((((((....)))))))))))))))))..)))))))).))).)))...))). -44.00 # aligned and folded structure * *** * *** ** * ** ***** ***** ************************* tcacaacctactgactgccagggcacttgggaatggcaaggaaaccgttaccattactgagtT atcaagcctgctgacagctgtggcacttgggaatggcgaggaaaccgttaccattactgagtT cca-agcctaccgacagctgtggcatttgggaatggcgaggaaaccgttaccattactgagtT tcc-agcctgctgaccgccaagacacttggggatggcgaggaaaccgttaccattactgagtT ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| 42122 4 144442244444444 44444444444444444 ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| cgtgcataa.................cacccatgtcgtTCTCTTGGTAATGGTAATGAT.... cgtatcaaa.................caccctcgtcgtTCTCTTGGTAATGGTAATGAT.... cgtgtcaaa.................caccctcgtcgtTCTCTTGGCAATGGTAATGAT.... cgtgcaaaa.................gacccatatcgtTCTCTTGGTAATGGTAATGAT.... *** **................. **** ************ ************.... >PREDICTED_MIR66 chr13 49521093 49521203 - 12.438 hsa-mir-16-1 gcaatgtcagcagtgcctTAGCAGCACGTAAATATTGGCGttaagattctaaaattatctccagtattaactgtgctgctgaagtaaggttgaccatactctacagtt------------------------------------gtg gcaatgtcagcggtgcctTAGCAGCACGTAAATATTGGCGttaagattctgaaattacctccagtattgactgtgctgctgaagtaaggttggcaatactctacaact------------------------------------gta gtgatgtcagcagtgcctTAGCAGCACGTAAATATTGGCGttaagattctaaaattatctccagtattaactgtgctgctgaagtaaggttggccatactctacagtttgatattttatagtataatatgttttacagtttaatatg gcaatgtcagcagtgcctTAGCAGCACGTAAATATTGGCGttaagattctaaaattatctccagtattaactgtgctgctgaagtaaggttgaccatactctacagtt------------------------------------gtg * ******** ************************************** ****** ********** *********************** * ********** * * (((((((((((..(((.((((((((((((.((((((((.(.(((..........))).).)))))))).)).)))))))))).)))..))))))...........)))------------------------------------)). -39.30 ....(((((((..(((.((((((((((((.((((((((.(.(((..........))).).)))))))).)).)))))))))).)))..))))))).............------------------------------------... -39.00 (((..((((((..(((.((((((((((((.((((((((.(.(((..........))).).)))))))).)).)))))))))).)))..))))))..)))................................................ -38.80 (((((((((((..(((.((((((((((((.((((((((.(.(((..........))).).)))))))).)).)))))))))).)))..))))))...........)))------------------------------------)). -39.30 # aligned and folded structure .* .................................... **...........****** ***************.*********************** *** .gc....................................aat...........gtcagcagtgcctTAGCAGCAC.GTAAATATTGGCGttaagattctaaaa .gc....................................aat...........gtcagcggtgcctTAGCAGCAC.GTAAATATTGGCGttaagattctgaaa .gt....................................gat...........gtcagcagtgcctTAGCAGCAC.GTAAATATTGGCGttaagattctaaaa .gc....................................aat...........gtcagcagtgcctTAGCAGCAC.GTAAATATTGGCGttaagattctaaaa || ||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||| | ||| 44 434 444444 444 4444444444 44 44444444 4 444 || ||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||| | ||| gtg------------------------------------ttgacatctcataccagttggaatgaagtcgtcgtgtcaattatgacctctatt.......... gtataatttgacattttgtataatatgatattttatagtttgacatctcataccggttggaatgaagtcgtcgtgtcaattatgacctctatt.......... atg------------------------------------tcaacatctcataacggttggaatgaagtcgtcgtgtcagttatgacctccatt.......... gtg------------------------------------ttgacatctcataccagttggaatgaagtcgtcgtgtcaattatgacctctatt.......... * * ********** * *********************** ********** ***.......... >PREDICTED_MIR67 chr9 94018164 94018274 + 12.382 hsa-let-7f-1 cagaag-aaaacattgctctatcagaGTGAGGTAGTAGATTGTATAGTtgtggggtagtgattttaccctgttcaggagataactatacaatctattgccttccctgaggag cagaag-aaaaacttgctctatcagaGTGAGGTAGTAGATTGTATAGTtgtggggtagtgattttaccctgtttaggagataactatacaatctattgccttccctgaggag cagaagaaaaaaattgctctatcagaGTGAGGTAGTAGATTGTATAGTtgtggggtagtgattttaccctgtttaggagataactatacaatctattgccttccctgaggag cagaag-aaaagattgctctatcagaGTGAGGTAGTAGATTGTATAGTtgtggggtagtgattttaccctgttcaggagataactatacaatctattgccttccctgaggag ****** **** ************************************************************ ************************************** ......-.........((((.((((.(..(((((((((((((((((((((((((((((.....))))))).........))))))))))))))))))))))..))))))))) -47.40 ......-.........((((.((((.(..(((((((((((((((((((((((((((((.....))))))).........))))))))))))))))))))))..))))))))) -47.40 ................((((.((((.(..(((((((((((((((((((((((((((((.....))))))).........))))))))))))))))))))))..))))))